The Intrahepatic Cholangiocarcinoma in tissue microarray (Biomax)

LV2081與LV8011都有ICC cases,比較如下。




















合 (LV1503, LV247, LV642)
























#1由 sufang 在 三, 09/24/2014 – 03:53 發表。
測試片呢?
請問這些都是正片嗎?記得maruko在做DDR1時好像有種較破損便宜的測試片可供做條件測試,可以請教一下小丸 看看值不值得加購!
另外, you know what, 妳們找到、附的IDO1 refernece也是用IHC篩選IDO1在OSCC檢體中表現情形耶! 看來這個技術有夠重要.(I like the 掃片功能at Academia Sinica. 是大頭的功勞嗎?)
#2由 natsumi 在 三, 09/24/2014 – 15:32 發表。
回應
1.這些都是正片,我們在看的這幾片沒有測試片。
想比之下測試片真的很便宜,現在買(*38)就比丸子第一次買還時還貴,也許之後還會漲價也不一定,我自己覺得可以買,這個我再跟丸子討論一下。
2. 嗯嗯,有唷,我有看到用IHC篩選IDO1在OSCC檢體中表現情形,IHC也是一門藝術。
3. 掃片功能是軒鈺教我的唷,省了很多用顯微鏡照相的時間,眼睛也不會花掉。
4.另外,剛剛發現LV20810的27例cholangiocellular carcinoma,與LV2081比對,這27例當中有9例與LV2081的ICC cases是overlap的,因此,一樣的9例在LV2081就可以寫說是ICC,不知道為什麼LV20810不寫清楚,不知道cholangiocellular carcinoma當中有哪些是ICC cases? 這個問題sales說會再另請專員回覆我。
#3由 natsumi 在 四, 10/02/2014 – 16:08 發表。
做選擇
    為什麼overlap的組織在LV2081描寫為ICC,在LV20810則描寫為cholangiocellular carcinoma? 原本猜想應該只是同一個donor就會overlap到,但志德先生回覆我說overlap到的一定是同一個組織來源,後來我找到ㄧ樣被overlap到但在LV642描寫為惡性腫瘤,另一個在LV8011則為發炎組織,我就再詢問了一次。這次志德 晏先生就馬上幫我寫信問了原廠,結果就是Overlap到的就是指同一donor,他可能會有好幾個不同的組織來源,所以在不同片會有不同的描寫。
    Biomax網站上的資訊其實寫得滿清楚的,有寫intrahepatic cholangiocarcinoma的就不會錯,所以目前想在有明確描述為intrahepatic cholangiocarcinoma cases並且有normal cases的LV2081(20個ICC cases, US565)及LV8011(12個ICC cases, US255)作選擇。  
    Our customer has a question on one overlapping case between LV642 (A1) and LV8011 (G2).  They are supposed to be the same case, yet, they seem to have different descriptions.
LV642 (A1) – Type: Malignant with grade/stage/TNM information
LV8011 (G2) – Type: Inflammation withOUT grade/stage/TNM information
Please verify and advise, thank you.
Best Regards,
回覆如下
Your client was right about the overlapping cases. But the function of the Comparison is only for showing the overlapping Donor (CASES), not the individual blocks so it is possible that the two blocks in the two arrays were from different part, one was tumor and the other was the tumor adjacent or NAT (normal adjacent tissue)
#4由 sufang 在 一, 10/06/2014 – 09:08 發表。

各買一片

會不會很奢侈? cheeky

#5
由 natsumi 在 二, 10/07/2014 – 14:45 發表。

其實,我也想這麼做~

既然老闆也說了,就這麼辦! ^__^ 
兩片總共31160。
擔心的是positive rate很低…
#6由 sufang 在 四, 10/09/2014 – 08:59 發表。

10%算是不錯了!

文獻上目前估計約10%IHCC有FGFR2 fusion. 算是不錯了!
另外,我想讓奕宏漸漸熟悉IHC的實驗,請妳在可以讓他觀摩學習、甚或幫忙的情況下 帶著他熟悉這部分實驗。謝謝!!

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