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09/25 Lab Meeting- 小嬿

Progress report 1. 比對RRE與CBS的差異. RRE的序列可能為16~18 bp, 主要由兩個core element(GNCC和GGNG)和中間間隔的8~10個nucleotides所組成. 若以分析RRE方式分析CBS, 可發現CBS與RRE的序列組合有高度相似性, CBS也有兩個core element, 差別在於隔開core element的序列只有7個nucleotide.–> Rta是否可能透過結合在類似CBS的DNA序列干擾CTCF對基因表現的調控.–>> 注意CpG, RRE, CBS相對位置 2. 觀察在EREV8和ERKV細胞中, Rta所調控基因的蛋白及RNA表現量的改變. EBV Rta在Dox誘導表現之下, 可在3小時被偵測到; 而細胞週期調控蛋白c-Myc和CCND1在Rta表現3-6小時表現量下降; p21及14-3-3σ在6小時表現量上升; 病毒溶裂期蛋白則在12-24小時才有明顯的表現量產生. –> Rta表現後改變許多細胞周期相關基因的表現, 而這些基因的promoter或intron上有CBS存在. 3. CTCF 可能扮演壓制EBV或KSHV不能進入lytic cycle複製的角色. 若外送質體表現較多的CTCF於細胞中, 可以發現EBV和KSHV的溶裂期蛋白表現被抑制, 細胞中的病毒DNA套數減少; 相反地, 以shRNA方式減低CTCF表現量時, 可以發現EBV和KSHV病毒的溶裂期蛋白表現, 並且細胞中的病毒DNA有增加的趨勢. 4. Rta結合於DNA上的功能對於基因的調控是重要的. 外送EBV Rta的DNA binding mutant(K156A)進入細胞中, 可以發現Rta原來調控的基因, 在K156A組別中的反應都較小. 5. EBV Rta結合到DNA上讓CTCF無法穩定地坐落於DNA上. 以ChIP assay觀察目標DNA片段, 可以看到大約在Rta表現6-12小時就可看到Rta結合在DNA上, 而CTCF的訊號則在較後面的時間點(24小時)變弱.–>> […]

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Prof Chow 周芷 visit

E2: dimerE1: di-hexamerOnce integrated, HPV is no longer reproducible. G0: basal cellsHPV DNA amplifies during G2 arrest (CCNB in the cytoplasm) p130 is the key: disappears and re-appear during keratinocyte differentiation (reactivates cell cycle, promoting S-phase); N268D U0126

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放鬆的方式有很多種

實驗室減壓方式有許多種 但是SFL覺得重點只有一個 就是要 〔放得下〕 學習放下批評者和你的看法不同處 學習放下你和惹你懊惱者的不同處 學習放下時間老是不夠用的惡習 早一點動手 承認無法接受這份工作

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2013-10-01 Journal Club

大家好,這篇是蕃茄10/01要報告的paper,請查收,謝謝! (Elevation of S100A4 expression in buccal mucosal fibroblasts by arecoline–involvement in the pathogenesis of oral submucous fibrosis-PLoS One 2013) 大家好,這一篇是2號版主附贈的相關paper,請查收,謝謝!(Identification of two distinct carcinoma-associated fibroblast subtypes with differential tumor-promoting abilities in oral squamous cell carcinoma.)

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09/18 Lab Meeting

小羊畢業口試rehearsal! ——– 意見彙整:Major Comment:1. 不要對著螢幕解釋抄來的英文內容,這是論文口試、不是即席英文翻譯。試著把英文二行以上的句子縮短微小於二行、或是直接改成中文。另外要時時看一下聽眾的反應。2. 要打講稿,注意大約一分鐘一張slide。3. 覺得不好講的地方要用圖表幫忙。4. Introduction 是不是改成 口腔癌–> Gene Fusion–> FGFR3 –> TACC3 會不會比較順? (或許論文也應該這樣子編排比較好。不過別擔心,有了「Insert目錄後」,改那個很快)5. Cell Line 名稱要做個簡單的表格、在需要的地方帶出來,因為不做這個題目的不熟這些cell line, 會不知所云。Specific Comments (slide number 可能會差一、二號):Slide 1 :頭頸癌的skin若發生病變應屬皮膚癌而非HNSCC. 1982到2013才上升一位,不能叫做一路攀升。應強調男性發生率及癌症死亡率即可Slide 3 (cartoon of FGFR3 signalling pathways): 明明是五個箭頭、為什麼你卻說四個pathway?Slides 3 & 4: tyrosine kinase domain 要指對地方。Slide 8: 英文有錯,考慮用中文。Slide 10: 圖扭曲得很難看.  TMPRSS2 是 protease? 那保留甚麼功能區? 圖A和C不同點在哪裡?Slide X (結果第一張) 要附 F3-T3、抗體、shRNA位點的示意圖,而不是一直對著空中指指點點。Slide

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六祖壇經精選

本系列講座中,聖嚴法師以四大主題,展現《六祖壇經》的精華內容。《壇經》不僅是惠能大師一生說法的精要紀錄,亦是最具代表性的中國禪宗寶典。透過聖嚴法師生活化與現代化的講解,我們將更能體會禪法的活潑與實用,了解到一切煩惱都源自內心的執著。只要在生活中體驗佛法、練習運用佛法,學習不被外境所動,,在自身親見佛的三身!(法鼓山普化中心) 之一:無相三皈依 (一~四 01-04)聖嚴法師說:「用心外的三寶,幫助我們發現心內的三寶,這是最可靠的」。讓我們循著「六祖壇經」的智慧法語,開發本具的自性三寶,回到生命的真正歸依處。 之二:一體三身自性佛(一~三 05-07) 聖嚴法師告訴我們,因眾生根器不一,所見的佛也不一樣。然而,佛雖有三身,實則本體為一,且無處不在。回歸自性的當下,即能成就佛的「一體三身」。 之三:三身佛 (清淨法身佛之一~三 08-10; 千百億化身佛 11; 圓滿報身佛之一~二 12-13) 聖嚴法師進一步解說,在日常生活中,只要一個轉念,煩惱消失,智慧即現前。因此,每個人都可以親證佛的三身,展現慈悲與智慧的光明。 之四:無相頌 (一~五 14-18) 聖嚴法師提醒我們,修行不只是要止惡行善,乃至一切善法都得放下。要以無所求的心,如此一來,所做的一切,就是種下出世得解脫的正因。 之五:參請機緣(一~七  19-25) 內容主要為六祖大師與其得法弟子間的對話,說明修行得力時可能會遇見的窒礙與執著,乃至如何透過正見的導歸,讓自己能真正與佛陀的智慧相應相契。   

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聖嚴師父楞嚴經專欄

2009年:「觀音妙智」編者序: 聖嚴法師從一九八四年十二月於美國紐約的東初禪寺開始講解《楞嚴經》,其中的耳根圓通部分,從一九九五年十一月開始,至二○○五年六月為止,前後歷時將近十年之久。本書是從講經期間的四十八場講座、五十八卷錄音帶中整理、編輯而成。法師親自修訂,於不足之處錄音補充,並於二○○七年五月二日,在晚年養病的臺北中正精舍完成修訂。全書保留了法師生前審定的「問答」部分,法鼓文化經過一年多的編輯,延宕多時,至今日出版。【註:果鏡法師的演講則提及師父花了12年在美國東初禪寺講第六卷 耳根圓通 = 觀音妙智一書。說這是修成最快的法門;文殊師利菩薩也是在楞嚴會上大力稱揚。在台灣則只講到第二卷就沒有因緣了。】 2013/09/10 (法鼓山普化中心)《楞嚴經》講要系列課程,是聖嚴法師於1995年,在農禪寺講座的珍貴錄影。《楞嚴經》是漢傳佛教中極為重要的一部經典,有所謂:「自從一讀楞嚴後,不看人間糟粕書。」的讚歎,亦是一部轉迷為悟的寶典,能引領人們從迷失中覺悟,從虛妄中發現真實,開發生命的大悲大智。聖嚴法師以生活化的譬喻和故事,精闢解說《楞嚴經》第一卷、第二卷的要義,將精深的經義內涵,化為淺顯易懂不再艱深難解的修行指南,並且透過豐富的舉例,轉化為日常生活中可隨時隨地實踐的觀念,而能在生活中隨時體會佛法的利益。 是全經共分為十卷,第一卷敘說阿難尊者在托缽乞食的時候,被摩登伽之女(名缽吉帝)用外道幻術及咒語所迷惑,當時的阿難因為尚未證阿羅漢果,所以幾乎破了淫戒。後來文殊菩薩奉了佛陀的指示,將阿難救出,連同摩登伽女一起帶到佛前,兩人同時懺悔,並且修學佛法。 <七處徵心>第二卷闡述理論,說明眾生都有真性,也就是佛性,本來是清淨的,但是由於眾生自己造了種種的業,所以產生了顛倒、分別,因而變成眾生。<十番顯見>第三卷和第四卷分別說明宇宙及人生的形成、性質與現象,也就是宇宙觀和人生觀。第五卷和第六卷,是佛的大弟子阿羅漢和菩薩們,在佛前述說自己最初是如何修行?如何得道?用的是什麼方法?證得什麼果位而得到圓滿通達?一共有二十五種圓通法門;第六卷則是介紹觀世音菩薩的耳根圓通法門,說明觀世音菩薩是如何用耳根聽聞佛法、廣度眾生,因而成就了三十二種化身。這二十五位成就了的聖者,都可以做為我們學習的典範。第七卷則說出了〈楞嚴咒〉,共有四百三十九句,並且說明誦〈楞嚴咒〉的功德和功用。(熟的話 14分鐘可誦一遍)第八卷分成上下兩個方向來解釋,首先說明眾生要向上修行,應該要修三摩地,破種種顛倒妄見,經過五十七個菩薩階位,然後進入本元真如,終至成佛。五十七個階位,從乾慧地、十信、十住、十行、十迴向、煖、頂、忍、世第一,再加上十地、等覺,乃至妙覺等,一共五十七個;其次說明眾生向下,也就是墮落到地獄,有十種因、六種果,都是自己造業、自己感受差別的果報。第九卷講的是「三界二十五有」的種種形相。「三界」指的是欲界、色界、無色界,「二十五有」是在三界之中,有二十五種類別的眾生,各有種種形相。第十卷非常重要,是介紹十種外道的惡見或邪見,多是當時的哲學家,而這十種見解皆使我們無法出離三界,是永遠沉淪於生死苦海的原因。此外,這一卷也說明了修行禪定時,容易出現的十種魔境 2013-YouTube 聽經講記 (2019開始通車囉! From GTask/GKeep undated) 01《楞嚴經》講要卷一01序分(一)經題 〖本集開示聖嚴法師詳細解說經題,讓我們一起來認識《楞嚴經》這部重要的修行寶典。〗02《楞嚴經》講要卷一02序分(二)與會大眾 〖迦陵仙音徧十方界,恒沙菩薩來聚道場,文殊師利而為上首」。在何時何地?什麼因緣?會集了無數的大比丘、大菩薩、護法天神,共同來聽《楞嚴經》這部的殊勝妙法,本集開示­將為您揭曉。〗03《楞嚴經》講要卷一03序分(三)阿難與摩登伽女〖楞嚴咒〉被譽為咒中之王,本集介紹了咒語的來源,也就是《楞嚴經》中最精彩的一則故事,也是本經緣起的故事,那就是阿難尊者遇到摩登伽女的幻術無法脫身,佛陀遂遣文殊菩­薩持此咒救護阿難,幻術遇咒而解。〗04《楞嚴經》講要卷一04序分四阿難啟請〖阿難尊者與摩登伽女的故事,開啟了佛陀宣說《楞嚴經》的因緣。獲救的阿難及摩登伽女同歸佛所,阿難慚愧「一向多聞,未全道力」,悲泣懇請佛陀宣說修行定力之法,而促成了楞­嚴會,日後結集為《楞嚴經》。〗05《楞嚴經》講要卷一05七處徵心(一)執心在身內〖(SF:若在身內當見各臟器)〗06《楞嚴經》講要卷一06七處徵心(二)執心在身外〖(SF:若在身外當見七竅)〗07《楞嚴經》講要卷一07七處徵心(三)執心潛眼根〖(SF: (1) 唯識 浮塵根 (外表六根形相 即眼耳鼻舌身意 浮在身經根上之意) (2) 扶根塵即神經之意; 師父比喻如戴眼鏡之人必當見眼鏡=琉璃碗)〗08《楞嚴經》講要卷一08七處徵心(四)執心分明暗〖「七處徵心」的第四處,本集阿難尊者提出,張開眼睛能「見外」,閉上眼睛見到黑暗即「見內」。佛陀對此提出質疑,再次破除了心在內或在外的說法。(SF: 有兩種方式見得了身內 1. 打坐氣脈通了 以第六感得知 但非神通 像在印度、古老中國的醫藥 均是以此方式 認知體內 2. 神通之力。但在楞嚴會上 上述兩種方式皆不可行; 阿難提出心向內則見暗、向外則見明,佛說這也不對。向內見暗,表示心被黑暗包起來了 就無法見到五臟六腑、若心與暗合而為一那如何能見呢? 藕益大師: 此復計心在內也。初計內時。佛以不能見內難之。今云見暗卽是見內。正轉救初難也。 此中先以對不對雙牒。次雙破也。若與眼對下。先破對。又二意。一者旣對則非內。二者許內則有過。若不對下。次破不對。只須云何成見一句也。| 恐彼又轉救云。開眼見外。名為外對。閉眼見暗。名為內對。則暗仍與眼對。而亦不取室暗為焦腑也。今卽牒而破之。旣許內對。則開眼時。亦可內對而見其面。若開眼不能內對而見其面。則閉眼亦何能成內對乎。又設許內對見面。則心眼俱在虛空 仍違汝心在身內之計矣。| 恐彼救云。設許心眼俱在虛空。亦復何過。今更牒而破之。若在虛空。便非汝體。則如來今見汝面。卽應如來亦是汝身之眼。汝眼已知。身猶應未覺也。|恐彼更轉救云。眼雖在空。何妨眼知身亦隨覺。今更破云。若許眼在虛空。仍復與身兩處皆覺。則現有二知。當成兩佛矣。夫成佛時。雖復化身無數。祗如月印千江。豈可謂法身有二體耶。)〗09《楞嚴經》講要卷一09七處徵心(五)執心則隨有〖 「七處徵心」的第五處,阿難尊者引用佛陀曾說的:「心生種種法生」,主張心無定處,而­是隨緣所生。佛陀卻反問,如果心沒有本體,又怎麼可能生出種種的法?精彩問答引導我們­進一步地思惟。(藕益大師: 阿難雖則雙述心生法生之文。而意惟在法生故心生。且又不知妄心無體。計此緣影以為能合。種種諸法以為所合。故佛牒計中不須更出前之兩句。以前兩句非彼妄計張本故也。夫妄心的確無體。但阿難久執有體。不達本無。故今得以無體難之。是心者。指彼所執緣影也。旣不知緣影非心。則必妄謂有體。斷斷不敢承當無體之義矣。六塵十八界。全體皆卽自心。今獨計此緣影以為自心。則塵界並為心外之法。更欲以此無體之緣心。來合諸法。何異欲以第七無體之塵。合成第十九無體之界乎。是義必不然矣。 | 破: 若有體者。如汝以手自挃其體。汝所知心。為復內出。為從外入。若復內出。還見身中。若從外來。先合見面。阿難言。見是其眼。心知非眼。為見非義。佛言。若眼能見。汝在室中。門能見不。則諸已死。尚有眼存。應皆見 物。若見物者。云何名死。此正破妄心。而乘便兼破妄眼也。浮塵之眼。不能有見。緣影之心。何能有知。噫。可以思矣。阿難。又汝覺了能知之心若必有體。為復一體。為有多體。今在汝身。為復徧體。為不徧體。若一體者。則汝以手挃一支時。四支應覺。若咸覺者。挃應無在。若挃 有所。則汝一體。自不能成。若多體者。則成多人。何體為汝。若徧體者。同前所挃。若不徧者。當汝觸頭亦觸其足。頭有所覺。足應無知。今汝不然。先立四句。然後一一破之。初一體句。謂四支共一心體。故以咸覺為難。設使咸覺。則挃無偏在。今挃旣偏有所在。則咸覺義墮。而四支共一心體不成矣。次多體 句。卽是多心。故是多人。三徧體句。謂一心滿於四支。與前四支共一心體是同。故亦同前所難。四不徧句。謂一心不能徧應。故宜一處有知。一處無知也。今汝不

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