練習英文又可檢驗自我科研潛力的好東西

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早上被家中電腦可以上網卻又無法上Google網站煩到不行，逛啊逛得看到這一個site (按我). 看到幾篇title很有趣的文章:Q&A: Douglas OsheroffFinding fascination in nature Nature 490, S8–S9 (11 October 2012)——————————————————Q&A: William PhillipsIn search of ignorance Nature 490, S11–S12 (11 October 2012)——————————————————Graduate students: Aspirations and anxietiesGene Russo Nature 475, 533–535 (27 July 2011)——————————————————Postdoc or not?Karen Kaplan Nature 483, 499–500 (21 March 2012)—————————————————— Job applications: Straight to the top of the pileKaren Kaplan Nature 488, 241–243 (08

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1017 Lab Meeting-FYC

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Progress Report1. 探討oral cancer cell lines中MMP-2以及MMP-9與DDR1之間的關係a) 透過Western blot發現在oral cancer cell lines中,MMP-2 protein的表現與DDR1間較有關聯,MMP-9則無b) 利用Zymography偵測MMP-2以及MMP-9的活性則發現,在oral cancer cell lines中,以MMP-9的活性較為明顯,MMP-2則無–>以後如果要做深入的研究會以MMP-2方向進行,因與DDR1關聯性較高 2. 研究台灣oral cancer cell lines中的FGFR3-TACC3 gene fusiona) 透過PCR analysis可在C8以及C9 oral cancer cell lines中發現確實有FGFR3-TACC3的gene fusion情況b) 透過DNA sequencing可定出在C8及C9中FGFR3-TACC3在genomic DNA level上的breakpoint site–>之後希望選出一對適合的primer在gDNA上能順利work,再去偵測clinical sample的gDNA中有沒有FGFR3-TACC3 gene fusion的情形

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amazing~人瑞生子的時代快來臨了～

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        根據今天刊登在「科學」雜誌（Science）的研究報告，日本京都大學研究團隊利用iPS的技術成功將母鼠取出的幹細胞，誘導成卵子，再進行體外受精後植入代理孕母老鼠，並成功生下健康子鼠，並能繁殖下一代。連同他們之前的研究：從公鼠身上取出幹細胞，利用iPS的技術誘導成精子，未來八十歲的老爺爺老奶奶想生小孩可能不是夢想了!iPS真的是太神奇了～ 新聞稿      science report                                                                                           

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cBIO Cancer Genomic Portal

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cBIO cBIO database is one browser of Cancer Genome Anatomy Projects (CGAP).This project is supported by NIH and NCI that 20 cancer types will analyse with Copy-number (Array-CGH), mRNA expression (RNA-seq), mutation (NGS), and DNA methylation status between clinical tumor samples and adjust normal tissues. Now, there are 7 type of cancers  that have finished this project and can

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0919 Lab Meeting-YJC

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Progress Report 1. 欲觀察CTCF是否在EBV/KSHV的潛伏期中扮演repressor的角色:a) 利用shRNA-lentivirus infection方式knockdown CTCF expression五天之後, 發現病毒RNA/protein表現量上升, 存在於細胞中及release到上清液的的病毒DNA copies也變多. –> shCTCF clone B情況較特殊, 將mix其他三個clone的病毒液再觀察一次結果 –> viral transcripts/protein可多看BMRF1, K-bZIPb) 將CTCF表現質體送入細胞中表現3天, 發現病毒RNA/protein表現量沒有變化, 存在於細胞中及release到上清液的病毒DNA copies變化也不大 –> 調整細胞濃度做DNA transfection再觀察一次 2. 利用ChIP方式觀察EBV Rta表現是否影響CTCF結合於病毒基因體的能力. 初步結果可觀察到Dox-48hr細胞中, CTCF binding量比non-induction少; 而Rta除了binding在已知的RRE之外, 在目前所偵測的DNA片段上也都有Rta的訊號. –> EREV8的ChIP訊號都比ERKV弱, 需要多加確認 –> ChIP所得DNA量太少, 將做些調整以提高所得DNA濃度

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