LabLog-小夏篇

#1由 EVKVLIN 在 二, 05/12/2015 – 15:07 發表。

2014/05/20 IFA assay for p-gH2AX(S139) in dox-treated 293TetER

AE703 Immunofluorescence assay for p-gH2AX(S139) in dox-treated 293TetER
5/6 Seed 1X10^5/6-well in 22mmx22mm coverslip
5/7 add Dox50ng/ml 5days
5/12 Immunofluorescence assay
–> Fix with
A. 100% iced MeOH -20degreeC 5min (3片NC,3片Dox)
B. 2% paraformaldehyde RT10min (2片NC,2片Dox)
==> to test the fix condition (AE702)
5/15
Fixed with 2% paraformaldehyde in PBS for 10min at room temperature, and permeabilized with 0.1%Triton X-100 for 5min at room temperature (3片NC,3片Dox)
 p-gH2AX(S139)1:500 4degreeC O/N

#2由 EVKVLIN 在 二, 05/12/2015 – 15:05 發表。

2014/05/05 IFA assay for HP1gamma in dox-treated 293TetER

AE700 試試 HP1gamma IFA的條件(1:400 to 1:200)
seed 293TetER 1X105/well in 6-well plate
treated with dox for 5 days
IFA: Fix with 100% iced MeOH -20degreeC 5 min
結果一抗1:200仍然很弱,考慮下次1:50。
由AE702結果看起來,2% paraformaldehyde RT10-15min固定條件下,細胞樣子較漂亮。

#3由 EVKVLIN 在 二, 05/12/2015 – 15:01 發表。

2014/08/05 Immunohistochemistry of FGFR3

Slide 1
Slide 2
Slide 3
Antigen retrieval在ph9的條件下,染在的位置大部分在細胞質(如箭頭所示),而pH6的條件下,FGFR3染到的位置主要在細胞核。
Slide 4
Slide 5
Slids 6

#4由 EVKVLIN 在 二, 05/12/2015 – 14:57 發表。

2014/4/9 SAHF staining by DAPI

AE370 SA-b-Gal staining of old OKB2 cells 
養著養著越來越變大的OKB2真的老掉了嗎? 結果8成以上細胞為SA-b-Gal positive staining。
AE371 SA-b-Gal and DAPI staining of NP460_hTERT cells in KSFM or DFK medium
將NP460hTERT養在KSFM或DFK medium一週,染SA-b-Gal為negative,同時試試看DAPI可以在同一個WELL中覆染嗎? 結果顯示可以同時染DAPI。
AE379 SA-b-Gal and DAPI staining of old OKB2 cells 
將YMH不要的old OKB2同時染SA-b-Gal與DAPI,想看看是否老化的細胞就有punctate DNA foci的現象(參考文獻),結果顯示大部分細胞並沒有punctate DNA foci。
討論
1.在coverslips染色會看得更清楚; 
2.拍照要注意將對比呈現得更好;
3:先試試單純DAPI的staining,排除不同固定方式或SA-b-Gal的干擾。
AE372 SA-b-Gal and DAPI staining of dox-treated 293TetER  
試著要將dox-treated 293TetER同時染SA-b-Gal與DAPI,想看看是否EBV Rta誘導的老化細胞就有punctate DNA foci的現象,結果顯示大部分細胞並沒有punctate DNA foci。
另外,DAPI staining觀察到的現象為: dox-treated 293TetER之細胞核形狀變不規則,有些許細胞核變大,甚至有兩倍大的差距。
討論
1.再改善一下DAPI條件試試看,先試試單純DAPI的staining;
2.細胞數可以再降(細胞數:5x10^4-2×10^5,此次用2×10^5);
3.試試染其他已被報導與老化相關之marker。

#5由 EVKVLIN 在 二, 05/12/2015 – 09:27 發表。

2014/8/28 FGFR2 antibody for IHC

IHC目前想先測試這兩支,會再多看其他有用這兩隻作IHC的paper。
(由於先前有與abcam原廠客訴FGFR3抗體不可以用,所以可以換一隻新的其他的抗體,這次應該可以換這支FGFR2抗體來試試)
下面是一些datasheet上Western的圖與建議的positive cell line

#6由 natsumi 在 五, 03/27/2015 – 10:46 發表。

AE734_Protocol and related products of AE733

Protocol
Related Products

#7由 natsumi 在 一, 01/12/2015 – 10:58 發表。

AE710/AE717 Western blotting of abcam ab10651 anti-FGFR3 Ab

Dear 玉蓮,
原廠回覆希望您可以修改一下protocol應該結果就會比較好:
 
​1. ​
 Change the blocking agent from milk to BSA. Block the membrane with 5% BSA in TBST for 1hr at RT
​2. ​
 Use 5% BSA in TBST as antibody diluent
​3. ​
 Run a “no primary” control to check whether the non-specific binding is from secondary antibody or not
​如果跑出來​結果還是一樣不好, 原廠會退錢喔!!
依照廠商要求再做一次Western
結果廠商答應可換同價格抗體一隻。

#8由 natsumi 在 一, 01/12/2015 – 10:48 發表。

AE716 IHC of FGFR3 in OR2081 and BL2081

#9由 natsumi 在 三, 01/07/2015 – 16:41 發表。

AE715 IHC of FGFR3 (B9:sc13121) in C9 and TW2.6

承接AE714結果想改善Santa Cruz(B9:sc13121)IHC之條件。參考Int. J. Dev. Biol. 57: 141-151 (2013)使用TEG Buffer作為retrival的條件。
另外,此次實驗改善background方法: 一抗作用前以0.1%BSA/PBS blocking0.5-1小時,並將一抗放在PBST改為PBS,來降低background。

#10由 natsumi 在 三, 01/07/2015 – 16:27 發表。

AE714 IHC of FGFR3 (B9 and ab10651) in C9 and TW2.6

此次實驗在細胞團塊C9,TW2.6來測試FGFR3的IHC條件
抗體有兩支:Santa Cruz B9:sc13121 (1:50) , abcam:ab10651 (1:600)
結果ab10651在C9與TW2.6上的結果不符合預期,而sc13121染色深度C9>TW2.6 ,符合預期,看起來有希望,接下來試驗將改善background深的問題。

#1由 natsumi 在 三, 01/07/2015 – 15:53 發表。

AE713 Immunohistochemistry staining of FGFR3 in OR2081t

#2由 natsumi 在 三, 01/07/2015 – 16:00 發表。

AE713(pH6)與AE716(pH9)做比較

AE713(pH6)的結果怪怪的。AE716(pH9)結果較好。
後記: J. Path. 2013 July: 270-276 IHC條件(B9) sc13121=1:50 Retrival所使用之CC1 buffer是弱鹼性的。
#3由 EVKVLIN 在 三, 11/12/2014 – 14:27 發表。

AE724 IHC of FGFR2 in tissue microarray LV2081 and LV8011

LV2081中20個ICC結果:
Cancer adjacent normal hapatic tissue
LV8011的12例ICC結果
Normal hepatic tissue

#4由 natsumi 在 二, 12/02/2014 – 11:04 發表。

AE724_Scan Version

#5由 EVKVLIN 在 二, 05/12/2015 – 08:53 發表。

2014/06/03 Progress Report

Slide 1
Slide1 : (Narita 2003) DNA foci accumulate in senescent cells
Slide 2
Slide 3
Slide 4
Slide 5
除了HP1gamma綠光較NC亮以外,細報核變大在此實驗也滿明顯的。
Slide 6
Slide 7
Slide 8
看起來還沒有找到最佳條件,儘管如此,gH2AX也不適合作為Rta誘導細胞老化的Hallmark,因此就先暫停於此。
Slide 9

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