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The history of primary infection of EBV in keratinocytes

2006/10 Molecular and cytogenetic changes involved in the immortalization of nasopharyngeal epithelial cells by telomerase (the link to NCBI) 2008/10/10 根據這一篇, 那送EBV進入NP460h-hTERT不就等同於把EBV關禁閉? 另外Dr.George Miller有篇在J.Virol.Methods(2006)的文章,看起來像是一位MD/PhD的學生做的。他以兩位IM病人血清(富含各種anti-EBV抗體)去分離經NaB處理過的P3HR1(HH514)細胞。分什麼呢?分那些在走lytic cycle和不被NaB活化的HH514。分下來後的細胞再送回去petri-dish養。結果發現走lytic cycle的細胞無一存活、而沒有induce的細胞可以再被養回來,而且induction rate隨著時間增加而增加。很有意思的一篇文章。George大學是學歷史的,非常會寫文章,邏輯性很強而且要言不贅,讀他的paper總覺得能做science真好。 2010/02  MTA_Signed_LinSF_NP460hTERT 2010/08 Epstein-Barr virus infection in immortalized nasopharyngeal epithelial cells: regulation of infection and phenotypic characterization (the link to NCBI) 2010/11 (YJC)AC301 To test the infectivity of Akata-p2089 […]

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IRB 問與答 2014年題庫

IRB 問與答 2014年題庫 由 sufang 在 二, 06/09/2015 – 09:09 發表  Oral Cancer   IRB   Oral Cancer Su-Fang Lin <sflin1@gmail.com> Jun 5 Reply to 張書銘, 陳雅雯, 江士昇, 夏興國 Dear All, 我PP計畫的IRB審查回來了, 兩個reviewer都有一點問題. 總評皆為「修正後推薦」。想請問大家先前有沒有碰到類似的問題, 其正解為何? 先謝謝大家的幫忙!  之後如果大家不介意的話, 我們是不是把各自的問題集合在一起、弄成一本題庫? 具IRB同仁說 送出去的審委不一樣、同樣的申請件, 碰到的問題都不一樣。  Thanks again!  Su-Fang (ext 35107)   (餘刪, 見下6/8回覆) Ya-Wen Chen Jun 5 Reply to me, 張書銘, 江士昇, 夏興國  以下是我遇到的問題及回答, 素芳的問題與我的問題有相似, 重點是(簡易審查核對表)提及使用合法生物資料庫..簡易審查核對表我更改成接續前階段研究之後續資料分析(湘如建議).  委員A本研究係以成大醫院口腔癌組織進行相關研究,其第16頁(簡易審查核對表)提及,係使用合法生物資料庫,請主持人具體說明該檢體來自於成大醫院哪個生物資料庫?回覆:更改成: 僅限於接續前階段研究之後續資料分析 其所使用之檢體系匿名化或去連結化?回覆: 去連結化 第24頁(免研究參與者同意申請書)所附成大醫院兩份IRB證書之相關研究計畫主題,是否與本計畫主題相關?回覆:是, 本計畫是以HR-97-100

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EBV and NGS

由 sufang 在 四, 06/04/2015 – 13:38 發表  Pre-published   EVKV   NGS 3552_2012_12_Whole genome sequencing of the Akata and Mutu Epstein-Barr virus (EBV) strains.pdf 3577_2011_11_Direct sequencing and characterization of a clinical isolate of Epstein-Barr virus from nasopharyngeal carcinoma tissue by using next-generation sequencing technology 3964_2014_02_Integrated mRNA and microRNA transcriptome sequencing characterizes sequence variants and mRNA–microRNA regulatory

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2016/105年待辦事項

2016/105年待辦事項 由 sufang 在 三, 05/27/2015 – 08:45 發表 Pre-published Gene Fusion HOK Lin Lab Oral Cancer Paper Submission 宛樺: DDR1 overexpression in OSCC  嬿如: EBV Rta mediated DNA methylation in the host genome   FGFR Gene Fusion related (玉蓮、奕宏) 1. FGFR2 gene fusion in cholangiocarcinoma (Post 連結) 2. FGFR3 gene fusion in oral cancer

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RBBS

RBBS由 sufang 在 三, 04/01/2015 – 09:00 發表 Pre-published RBBS 須細讀, 台大擬用此法screen HNSCC patients. Start: 04/01/2015

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OSCC Cell Line STR information 20150312 更新版

OSCC Cell Line STR information 20150312 更新版由 sufang 在 一, 03/30/2015 – 08:45 發表 Oral Cancer OSCC Cell Line STR analysis Dear all, 更新oral cancer相關細胞株之STR資訊共有16個細胞株, 其中DOK, FaDu, HOK, HSC-3, KB, OEC-M1, SCC-15, SCC-9, Tu-183(共9株)有送件STR的資訊(詳如附件)須請大家注意的資訊如下:1. HSC-3, 於Dr.郭靜娟’s lab的新HSC-3為真, 請非此來源者把舊的細胞扔了吧! (p.s Dr. 李岳倫於2014年7月及9月分別定的STR結果同新HSC-3, 推測亦為可用細胞株)2. KB, 於Dr.郭靜娟’s lab定STR結果為HeLa細胞, ATCC/JCRB資料庫也證明KB為HeLa. 請勿使用此細胞株!3. SCC-15, Dr.李岳倫’s lab 於2014年9月及10月分別定的STR結果皆與SAS細胞株相符(90.9% match), 使用此細胞株請小心!4. Tu-183, 於Dr.江士昇’s

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大家講過的Paper大全

2015/03/24 陳貞佩 Monensin inhibits epidermal growth factor receptor trafficking and activation: synergistic cytotoxicity in combination with EGFR inhibitors 2015/03/10 楊韻涵  NRF2-driven miR-125B1 and miR-29B1 transcriptional regulation controls a novel anti-apoptotic miRNA regulatory network for AML survival 2015/02/10 王思涵 Exosomes mediate stromal mobilization of autocrine Wnt-PCP signaling in breast cancer cell migration  2015/01/06 小嬿 RFTS-deleted DNMT1

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2015/01/30 國長會議

由 sufang 在 五, 03/13/2015 – 08:29 發表 Pre-published 國長會議 長庚 國衛院長庚雙邊會議 2015/01/30 (五) at 林口長庚 王陸海: miR491-3p is responsible for oral cancer metastasis葉大森: bile duct cancer (miRNA 200下降), liver cancer (miRNA 200 上升,which is correlated with EMT)陳鈴津教授介紹 閻紫宸教授另外一個專長是 radio pharmatheutical research (新藥開發 GMP等等)———————–趙盈凱 副教授【胸腔外科】可吸收性生物醫材在食道癌之應用東方人食道癌 是由ABC引起的、西方的食道癌則多由胃食道逆流證實CCRT+Surgert is better therapy than just surgery-Big Database (2400 病人

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TCGA HNSCC Marker Paper

由 sufang 在 五, 02/27/2015 – 10:08 發表 Oral Cancer HNSCC TCGA Comprehensive genomic characterization of head and neck squamous cell carcinomas (pdf 4292; PubMed Link) The Cancer Genome Atlas profiled 279 head and neck squamous cell carcinomas (HNSCCs) to provide a comprehensive landscape of somatic genomic alterations. Here we show that human-papillomavirus-associated tumours are dominated by helical

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