小嬿

二期癌症缺口計畫2015

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2015.01.15(W4) 11:00 am­ 口腔癌缺口計畫會議 總計畫中文: 針對台灣口腔癌前病變惡性轉化開發快速診斷與有效化學預防之整合研究 總計畫英文: Rapid diagnosis and effective chemoprevention for malignant transformation of oral potentially malignant disorders in Taiwan      計畫編號: MOHW103-TDU-212-114005 三月中旬舉行第二次meeting, 討論期中報告繳交． #1由 sufang 在 五, 05/29/2015 – 13:22 發表。 100例病人葉酸濃度紀錄 謝謝高醫、謝謝奕淇 2015/05 (n=20) #2由 mmiiee 在 二, 04/14/2015 – 09:09 發表。 口腔癌缺口計劃2015/4/8會議記錄 口腔癌缺口計劃2015/4/8會議記錄 日期: 2015年4月8日 (星期三) 時間: 10:00-12:30 am 地點: 竹南院區 研究大樓2樓 R2-2031會議室 出席人員: (出席人員以螢光筆標示之) 江士昇 […]

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EBV associated malignancies and IDO1 expression

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由 sufang 在 二, 10/28/2014 – 14:27 發表 Pre-published EBV EBV associated gastric cancer IDO1 Lymphoproliferative disorders PLoS Pathog. 2013;9(5):e1003341. doi: 10.1371/journal.ppat.1003341. Epub 2013 May 9.Differences in gastric carcinoma microenvironment stratify according to EBV infection intensity: implications for possible immune adjuvant therapy. Strong MJ1, Xu G, Coco J, Baribault C, Vinay DS, Lacey MR, Strong

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5年前的一個小實驗 (EBV and KSHV Methylation)

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由 natsumi 在 四, 07/17/2014 – 17:30 發表 EBV and KSHV Methylation 最近聽Dr. Lin講Methylation的故事，我想到之前曾經做過的一個小實驗，分享之。 AB851 #1由 ingrid 在 五, 07/18/2014 – 12:20 發表。 ER沒有被acetylated-lysine Ab認到 #2由 ingrid 在 五, 07/18/2014 – 15:30 發表。 其他Data #3由 sufang 在 五, 07/18/2014 – 14:48 發表。 是KR! 記錯了，所以ER什麼都沒有! 可能只有phosphorylation. -而且只有 Ser/Thr-phosphorylation. #4由 sufang 在 五, 07/18/2014 – 09:10 發表。

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LabLog-小嬿篇

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由 mmiiee 在 四, 04/03/2014 – 11:43 發表 LIN Lab 2016 LabLog mmiiee 小嬿 LogID Title  Initial  Date AC001 To test EBV DNA polymerase primer by Q-PCR (trial 2) YJC 3/21/10 AC003 Test induction efficiency of TW01-EREVp2089 clones by SB (trial 2) YJC 3/22/10 AC004 To detect EBV Rta level between EREV8 and NA cells

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關於EBV infection

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關於EBV infection的實驗, 以下是我的構想, 歡迎大家提供意見討論! 目前預訂 2014/04/03 recover NP460hTert2014/04/07 seed cells / concentrate virus2014/04/08 infection以上 #1由 ingrid 在 五, 04/11/2014 – 10:22 發表。 部分結果出爐 #2由 ingrid 在 一, 04/28/2014 – 16:39 發表。 Rta蛋白質在EBV感染OKB2後有表現出來喔!! #3由 sufang 在 一, 04/28/2014 – 16:46 發表。 讚! 濁水溪的Zta抗體好嗎? 我們沒有4F10了嗎? 同理，Argene的Rta比濁水溪的Rta好嗎? 張堯老師對我們的homemade Rta抗體真是讚不絕口。 #4由 ingrid 在 一, 05/05/2014 – 14:41 發表。 重新strip後，Zta抗體(4F10)及濁水溪的Rta皆沒有band。 #5由 mmiiee 在 一, 04/28/2014 – 16:41 發表。 AC619_film 附上之前做HEK293

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關於CCND1 promoter

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關於CCND1 promoter由 EVKVLIN 在 二, 04/01/2014 – 14:52 發表 EBV and KSHV CTCF Rta senescence03/25/2014 Dear 嬿如， 昨天張堯老師來電說第一次做出來的DAPA結果竟然與他們預測的不一樣 -> Rta binds to both the wild-type and the RRE mutated probes!所以我與他要了sequence來看看可能的解釋是什麼. (上次K156A的結果，有測CCND1嗎? Rta是直接結合到這個promoter上嗎? thank you)———————03/26/2014Dear Dr. Lin, 上次K156A的結果在CCND1上也不是很明顯(EREV8中wild type : K156A= 0.7: 0.76, 而在ERKV中為0.87: 1.21) (如附件Fig.1) 在CCND1 promoter上的potential RRE, 我是用5′-GNCC(N9)GGNG-3’預測出來的在張堯老師所設計的probe片段中沒有其他位置有GNCC(N8-N10)GGNG或是CC(N9)GG等選擇但是DAPA結果顯示Rta還是bind此段序列, 所以我猜core element的條件可能要更鬆一點我試用另一個序列來預測RRE(如附件Fig. 2)用interval region為8 bp的motif來搜尋probe片段, 則會發現CBS上可能有potential

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03/12- Progress Report-小嬿

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Fig. 1. CTCF repressed the lytic cycle replications of EBV and KSHV in viral latently infected cells.  > (a). The band of CTCF ectopic-expressed cells is over-exposed.  > (b). The expression level of shCTCF is similar to shLuc. Fig. 2. Rta binding sites are similar to CTCF binding sites Fig. 3. 4. EBV Rta expression

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Rta/CTCF MS related

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#2由 sufang 在 六, 05/09/2015 – 20:02 發表。Reviewers CommentsReviewers Comments From PLoS Pathogens (06/20–0/7/31, 6 wks) Reviewer #1: This is an interesting manuscript in which the model is advanced that EBV and KSHV Rta by binding to their respective genomes, induce local methylation which promulgates lytic replication and dissociation of CTCF, which is inhibitory to

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