基因定序3年後取代生物晶片 (台大余松良教授專訪)

報導日期:2009/3/16
報導來源:工商時報

1999年就在台大服務的俞松良是台大醫學院院長楊泮池研究團隊重要的輔佐大將,目前是台大醫學院醫學檢驗暨生物技術學系助理教授及台大 醫學卓越中心基因體醫學組微陣列核心與國家型基因體計畫整合性功能基因體學核心實驗室的共同主持人,經常以實驗室為家的他,樂於投入有趣且富挑戰性的研究 計畫。

俞松良因服國防役、於1999年到台大,開始為期四年的博士後研究,從2002年年底開始協助楊泮池的生物晶片實驗室(成立於 2000年)的運作,於2003年直接進入楊泮池的實驗室,為期約1年半。之後,進入台大醫院醫研部,並於2007年至醫技系任教職。因此從2002年起 就開始參與了楊泮池院長大部分的大型計畫,從觀念上的討論、研究計畫的撰寫、實驗的執行、實驗數據資料的分析與論文的撰寫等都有參與。

因 長期參與楊泮池各大型研究計畫,俞松良對楊泮池打從心底的佩服和景仰。他說,楊泮池是位人格特質和領導風格很少遇到且相當優質的人,「想法開放、充分授 權、學識淵博、文化涵養」是其主要特質,特別是不會因身為主管階層而有落後時代潮流的情況,他的想法總是更先進的跑在前頭,其學識涵養令人十分景仰而總能 信服於他。楊泮池領導下的計畫主持人、研究員或老師,一直到博士班、碩士班學生等整個研究團隊是比較活潑自由的團隊,有很好的實驗室文化及風氣,其在中研 院的實驗室著重於基礎研究,在台大醫學院的實驗室則著重於轉譯醫學及臨床診斷與治療方向,因設備完整,在醫院的檢體與國家經費及高通量篩檢儀器設備支援 下,可從事較大規模的實驗、收集檢體和進行篩檢。

俞松良指出,美國總統歐巴馬於去年提出CR21前瞻計畫,編列了很多預算在肺癌組織研 究,相較於台灣官方在癌症醫學研究的投資明顯不足於歐美各國的情況下;我們會專注於癌症組織研究,不能讓老美專美於前。他有信心證明楊泮池團隊在肺癌基因 體醫學的原創性概念,絕對不亞於歐美各國。

基因定序成重要分析平台

俞松良說,台灣從明年開始的國家型計畫,基因定序 已被點名為一重要分析平台,當成立基因及蛋白質結構分析核心設施實驗室後的幾年,基因定序平台將持續成熟,未來2~3年會有第三代、第四代定序儀等新技術 推出,台灣可以等嗎?如能買到更先進技術固然很好,研究成果如有好設備會加速其結果。但是,一個正確的研究加上充分運用現有設備,進而加快研究腳步,或許 會比等更新的設備還要更快,先做出來的先贏,而且在整個科研體系,量大未必是最好的,質精才是最好的,有「原創性概念」是最了不起的。原創性必須是第一個 發現或第一個證明概念,僅需少數檢體、少數經費(設備及資源),就可做到證明概念。後來的人就辛苦了,因為概念已經被證明了,接下來就要大規模驗證它,需 要很多檢體和數據資料。

因此,要有「足夠多的實驗儀器」和「分析數據的能力」,前者在台灣受限於經費,沒有辦法像國外研究中心,能在單 一機構就擁有很多設備,可藉由功能上集合幾個實驗室設備來達成;後者則是很有挑戰性的部分,甚至會比實驗操作本身有更高挑戰性。目前的做法是將現有資源集 結為若干大型整合性實驗室,另由生技公司參與計畫合作,例如:由Applied Biosystems(應用生命系統公司)提供3台新世代定序機器共同協助楊泮池院長大型計畫的進行,即是一種非常有效率的合作模式。

解決科學.醫界問題的良方

俞 松良表示,最慢3年後,整個基因定序系統將完全取代生物晶片系統。目前,機器型態仍會一直再升級,看得到的是新世代基因定序技術及其設備,很難想像未來 3~5年間,還有什麼科學方法可超越這樣的研究策略,將整個基因體研究,舉凡核酸研究,不管是DNA、RNA或各式各樣的基因體、表觀基因體等,都被其涵 括進去,更會發現全世界大型國家研究中心把很多經費都放在DNA定序設備上,它都可為解決各種基礎科學的興趣、疑問或臨床等問題提供很好的解決方式。

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