0610 生命科學院結構生物學程正取共： 5 名 （依准考證號排列）一般生 共 5 人06100001 李翊榮 06100002 林台文 06100003 周松濤 06100004 蔡彥俊06100006 林怡亭 08B 生科院醫學生物科技學程正取共： 6 名 （依准考證排列）一般生 共 6 人06080002 翁紹娙 06080004 陳瑜帆 06080005 鄒岳良 06080009 周松濤06080011 王義翔 06080013 劉秉鑫
厲害就是厲害-松濤又考上博士班了!! 怎麼辦呢! Read More »
Progress report:1. 欲確定在293TetLuc細胞中, Dox treatment 3-9hrs之間, CTCF結合在c-Myc/H19 promoter的pattern. 初步CTCF-ChIP assay結果顯示在兩個promoter上, CTCF的結合量未有明顯的改變. 之後將進行293TetER細胞的CTCF-ChIP assay. 2. 分析目前已知Rta會結合的promoters, 利用軟體預測Rta responsive element(RRE)/CTCF binding site(CBS)/sp1 binding site. 目前觀察到的情形如下:a) CTCF 與Rta結合位置重疊: BALF2, SFNb) CTCF 與Sp1結合位置重疊: p21, SFNc) CTCF/Rta/Sp1結合位置是鄰居: BLLF3, BHRF1/BHLF1分析結果未整理完全, 待續 3. 利用direct infection的方式建立攜帶螢光的293LucEV/293EREV. 所篩到的clone能被Dox induction出來的viral particles比EREV8少了至少10倍. 之後提高G418濃度也未能讓viral particles被release更多, 因此先停住這個實驗.
05/09 Lab Meeting-小嬿 Read More »
1.製備以下表現質體以供濁水溪公司代製兔子多株抗體 (1) pGEXHis_cZ :已分裝保存於-80℃冰箱。可用於WB(1:2000)(萍)、IFA(1:2000)(鏸)及免疫組織染色 (1:1000)(鏸)。(2) pGEXHis_ER_Q320stop and pGEXHis_ER_L550stop : Q320stop已送給濁水溪代製。另外構築pGEXHis_ER_277E-516V做蛋白質表達。(3) pGEXHis_KR_E600stop and pGEXHis_KR_Q658stop :蛋白質表現量太少(失敗)。(4) pGEXHis_BALF3 :蛋白質表現量太少(失敗)。 2.使用EGFP當目標基因來測試建立NP460TetR_ER inducible cell lines的條件：用未稀釋的lentivirus病毒液直接感染6小時後移除，細胞發綠光比例接近100%，之後細胞放大後，使用10 ug/ml zeocin作篩選16天，發現未加Dox與有加Dox的綠光比例類似，建議做WB(flag)作確認。 3.萍使用Mini-PROTEAN II multiscreen apparatus (Bio-rad)來進行抗體最佳稀釋倍數的實驗。相關資料在https://www.bio-rad.com/prd/en/US/LSR/PDP/f9ec3085-b590-44c6-9b36-b36876cad466/Mini-PROTEAN_II_Multiscreen_Apparatus 首先置備只有一個well的膠體，樣品量為單一well*20=200ug (萍通常使用量)，轉漬完的NC膜置於裝置內，略將裝置傾斜後，從下面的孔注入600ul抗體稀釋液(避免氣泡)，室溫靜置2小時後，以Tip移除抗體稀釋液，用TBST清洗3次後，將裝置打開把NC膜拿出，進行後續二抗的雜交實驗。
5/2 Lab Meeting-ingrid Read More »
IB Roninson pdf 1605, 1624 in Bound Book (Senescence 3/3) PDF 1624: Short-term expression of p21 led to rapid downregulation of genes involved in mitosis and DNA replication. However, a longer-term consequence of p21 induction resulted in the induction of multigenes (PDF 1605), many of which are involved in aging as well as secreting anti-apoptotic
Rta/p21/Senescence/Tumorigenesis Read More »
Have Fun (一份七頁的pdf) ~ (Click Me)
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1. 將DDR1 IP後的interacting proteins (no. 1-4) 切下後訂mass, 而no. 1約60 kDa, no. 2約75kDa, no. 3約85 kDa, no. 4約160 kDa的蛋白質, 其中最有興趣在一些OSCC細胞中可能有高度磷酸化的區域為no.2 利用MASCOT分析的結果統 整出較有可能的protein分別為 Heat shock 70 kDa protein 8, Heat shock 70 kDa protein 9 及 Polyadenylate-binding protein 1, 這些結果進一步需實驗進行驗證2. 利用OEC-M1處理Glivec後, 觀察抑制DDR1活性對OEC-M1的影響 結果發現細胞生長停止, 但細胞死亡的情形不明顯3. 觀察K2及K6細胞對Glivec的敏感性, 結果發現Glivec對於DDR1表達量較少的K2的生長抑制效果較差, 此結果仍須重複確認
0409 Lab meeting-蔡小丸 Read More »
—–Forwarded message—–附件是我下週要報的paper，(按我下載) 謝謝！ Y.-M.
04/18 Journal Club Paper Read More »
4/10 SFL wrote:Sorry FYC, 多兩篇給你! (ref new 1), (ref new 2)。另外, 下面的ref 3–7你可以先忽略不必看。—————————- 恭喜小丸子、Ingrid得獎!!也謝謝小夏、小嬿的努力，我們和knicks一樣→work as a team，個人獲獎就是整個team的榮耀! 所以請客這種事就是老闆出錢、夥計們出力就對了! 往下大家(包括FYC)的目標調整如下: 1. 要present的圖，包括平日lab meeting均要run一下統計。 2. EBV related: (a) Infection of NP460hTert with Akata-GFP EBV (ref 1, ref 2) (b) Rta-mediated genome organization (ref 3, ref 4, ref 5, ref 6, ref 7)。3. Oral cancer related : (a)
Dear all:下周二Journal Club本實驗室Mogi要報告的Paper：A microRNA regulon that mediates endothelial recruitment and metastasis by cancer cells.(我雞婆的幫Mogi Po網，請大家要用力看喔!)
04/03 Journal Club Paper Read More »
目前的工作: To determine the DDR1 mutations in 7 OSCC cell lines. Note:The external gene-specific primers and internal M13-appended PCR primers for activation loops and JM domain (Ref.1)(Ref.2) 這兩篇的mutation都與drug的sensitivity有關。 我稍微追了一下Ref.2: Cancer Cell 2005這篇以High-throughput DNA resequencing 在164 polycythemia vera病人當中的121位有 JAK2V617F missense mutation，其中41位homozygous mutation; 80位 heterozygous mutation。Homozygous mutations來自於mutation allele的duplication。這篇的貢獻在於Inhibition of the JAK2V617F kinase with a small molecule inhibitor
03/28 Lab Meeting- 小夏 Read More »