9/21 Lab Meeting-ingrid

報告Thorley-Lawson DA.在上個月的PLoS Pathogens發表的paper
A Novel Persistence Associated EBV miRNA Expression Profile Is Disrupted in Neoplasia.
作者利用primary normal infectious tissues : LCL, NCB, MemB及tumor biopsies : HD, NPC, GaCa, BL進行34種EBV miRNA分析。將12種BART miRNAs命名為latency III associated miRNAs。而這些miRNA在分類為latency I (BL) 及latency II (HD, NPC, GaCa) 腫瘤組織中皆失去控制而表現量增加;相對於另一群EBV miRNAs,則BHRF1 miRNAs (大部分皆表現在latency III的LCL) 則並未失去控制而表現量很低。接著以heat-map/clustering或principal component analysis進行資料分析,發現並沒有tumor-specific miRNA,但综合所有數據,的確可以將不同腫瘤分類,類似於電腦界及物理界的”secret sharing”定律,舉例說明,在約40種miRNAs中,任選5個miRNA就足以將腫瘤分類成功的機率約為60%。最後以細胞株進行分析,發現若以研究miRNA而言,這些腫瘤細胞的表現形式已與他們的來源腫瘤組織不同。

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