Progress report:
1. 欲確定在293TetLuc細胞中, Dox treatment 3-9hrs之間, CTCF結合在c-Myc/H19 promoter的pattern. 初步CTCF-ChIP assay結果顯示在兩個promoter上, CTCF的結合量未有明顯的改變. 之後將進行293TetER細胞的CTCF-ChIP assay.
2. 分析目前已知Rta會結合的promoters, 利用軟體預測Rta responsive element(RRE)/CTCF binding site(CBS)/sp1 binding site. 目前觀察到的情形如下:
a) CTCF 與Rta結合位置重疊: BALF2, SFN
b) CTCF 與Sp1結合位置重疊: p21, SFN
c) CTCF/Rta/Sp1結合位置是鄰居: BLLF3, BHRF1/BHLF1
分析結果未整理完全, 待續
3. 利用direct infection的方式建立攜帶螢光的293LucEV/293EREV. 所篩到的clone能被Dox induction出來的viral particles比EREV8少了至少10倍. 之後提高G418濃度也未能讓viral particles被release更多, 因此先停住這個實驗.