10/27 Lab Meeting- ingrid
測試從中研院買來針對OGT及MGEA5的shRNA系統1. 簡單以質體轉染送入細胞，再做Q-PCR，發現二者都可以成功抑制RNA的表現2. 包lentivirus感染送入細胞，再做Western blot analysis，發現可以成功抑制MGEA5蛋白質的表現。但OGT抗體尚未抓到條件，所以還未得知是否也有抑制。
10/27 Lab Meeting- ingrid Read More »
10/27 Lab Meeting- 小夏
1. The RNAs of TW02, TW03, TW04, TW05, TW06 are ready. The RNAs of HONE1 and TWO1 will be purified on next week.2. EBV Rta can induce G1 arrest in TW01TetERTA #7, #16 and #19 in my 1st trial (19≧16＞7).3. So far, to test the inhibition effect of U0126 in ERTA-induced EBV reactivation.
10/27 Lab Meeting- 小夏 Read More »
10/27 Lab Meeting- 小嬿
1. Establishment of several stable cell lines: Akata-p2089, TW01EREV-Akata/EGFP, TW03Tet, and TW05Tet. I need YCK’s help to screen TW03Tet and TW05 Tet cells. I’ll transfer these clones to YCK tomorrow. 2. To test sonication condition of ChIP.
10/27 Lab Meeting- 小嬿 Read More »
10/21 Lab meeting-蔡小丸
繼續報告DDR1 對於台灣的oral cancer cell lines的重要性並再討論 DDR1 mediated cell growth可能會經由 MAPK surivial pathway及嚼檳榔和 OSCC大量表達DDR1的關聯性 再度謝謝大家連三周 被我疲勞轟炸 及給我的寶貴建議
10/21 Lab meeting-蔡小丸 Read More »
10/14 Lab meeting-蔡小丸
報告DDR1 對於 台灣oral cancer cells扮演的角色之相關實驗整理．．須在加強的部分包含：導言強調台灣地區口腔癌的特異性．．Glivec所抑制的一群PTKs 在Glivec使用濃度上的相關性．．並再討論DDR1在oral cancer cell裡所mediated survival pathway討論 檳榔對於collagen及DDR1 是否有扮演什麼樣的角色．．還有 要再有自信一點 講出來！！下週再繼續．．辛苦大家了．．
10/14 Lab meeting-蔡小丸 Read More »
10/06 Lab meeting-蔡小丸
整理silence DDR1對於四株口腔癌細胞生長之影響及發現臨床用藥Glivec(an inhibitor of DDR1)會抑制口腔癌細胞之生長…
10/06 Lab meeting-蔡小丸 Read More »
09/29 LabMeeting ingrid
報告去英國參加EBV研討會的感想 針對我的POSTERDr. Tsao提出以下的問題1. TW01TetEREVp2089是否產生具有感染性病毒顆粒?(目前無)2. 有考慮送入Zta做stable clone嗎?(Rta在epithelial cell內比Zta更能夠活化EBV溶裂期)3. senescence與lytic cycle的關連?(以下簡述SEL在噗浪的發言 謝謝SFL:)Senescence大致分兩類,一種是replicative senescence就是telomere越來越短的”自然老化”; 另一類是oncogene-induced的senescence簡稱OIS.我們Rta造成的senescence屬第二型.) 另外報告1. Dr. Shannon C. Kenny的海報中，提出Na在上皮細胞中會與p53一同誘導lytic protein表現2. Dr. Tsao的海報中，他們建立了HONE1-EBV、HK1-EBV及NP460htert-EBV細胞株，其中前二者可以產出有感染力的病毒顆粒。送入EBV的方式則是用Akata 細胞株進行cell-to-cell contact方式進行，成功送入EBV的細胞會發綠光，再以TPA加以誘導使其進入lytic cycle以產生病毒。還有說明加入TPA，雖然細胞的綠光會變強，但並不表示一定會產生相對應多的病毒。
09/29 LabMeeting ingrid Read More »
10/06 Lab meeting 小嬿
介紹在英國看到的兩篇post (from Dr. Tsao)1. HONE1-EBV可不受外物刺激就自動產生病毒, HK1-EBV 需要外物刺激, NP460hTert-EBV推測是abortive reactivation(未知停在哪). 在TNF-alpha刺激的HK1-EBV, BMRF1的表現量與Qp相反, 似乎與BZLF1的量不成正相關.2. 有EBV存在的細胞株在營養缺乏的環境下較有利生存
10/06 Lab meeting 小嬿 Read More »
09/29 LabMeeting SFL
1. CTCF是一個疆界蛋白,調控基因體該被轉錄或不該被轉錄的區域。 最近Genome-wide的ChIP-chip或ChIP-sequencing訂出human genome上約有15,000~20,000個CTCF binding sites。2. EBV和KSHV genome也會被CTCF bind,尤其在KSHV的latecny control region及EBV 的Qp都有被報導過。但是,在此次EBV會議中,聽到二組做此實驗的人在討論由Raji cell中所map出來的區域好像頗有差異。所以參考data時要特別注意。3.EBV Rta的recognition site究竟為何?CTCF是個典型Zn finger protein(11個finger), 但是Rta卻不像。
09/29 LabMeeting SFL Read More »