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20130410 Lab Meeting-FYC

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FGFR3-TACC3 gene fusion 1.將Oral cancer的gDNA及cDNA臨床sample透過PCR的方法篩選完畢。 2.測試過不同方法進行Nested PCR，期望改善PCR結果smear的現象，目前看來效果有限。 3.之後的實驗方向 : 對手上的oral cancer sample進行分析，偵測其中是否含有C9 type的gene fusion或者已在其他cancer中被報導過、不同於C9 type的F3-T3 gene fusion。

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(舉手發問) 關於array Enrich 有沒有哪套軟體 或是 database 是可以將gene name / probe / expression ratio 輸入 去觀察哪些signaling pathway change的?

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HPV in oral cancer

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關於HPV in taiwan oral cancer 今年在生醫年會 有看到長庚解剖學科 鄭授德  副教授 有一張poster 是長庚所蒐集的OSCC case中 HPV P16的比率 (CISH & IHC)結果 裡面有 pathological characteristics 不同部位oral cancer 的patients HPV P16+ 的比率 在 40% ~ 60% overall 比率 也在一半左右 我記得是50出頭 但是 HPV 跟 survival rate / pathological characteristics  p value 都沒有顯著差異 Survival curve是有一比較低的狀況 因為 第一作者(鄭) 在現場拍他自己的海報 我本來以為是可以拍 但是 瞄久了 他就問 對這有興趣嗎?

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DDR1 新作

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J Biol Chem. 2013 Mar 21. Shedding of discoidin domain receptor (DDR) 1 by membrane type (MT)-matrix metalloproteinases (MMPs). Fu et al.  Wayne State University, United States

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LabMeeting-小嬿

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LabMeeting-小嬿由 EVKVLIN 在 二, 03/12/2013 – 00:00 發表 LIN Lab 2016 LabMeeting mmiiee 小嬿 2008/08/27 小女子深受luciferase assay的internal control困擾所以上網找其他人有沒有這類的東西看到了一個網址http://www.protocol-online.org/biology-forums/posts/11321.html可是這個人的問題是他的internal control會降低跟我的不太一樣後面有個人(doles)有建議 可以試試看phRL vector是個合成的RL, 據說比較不會受到non specific的activator 影響而且我剛剛又去看了一下珮雯學姊的論文他用的就是Promega的phRL-TK是因為這個原因所以他做起來才不會受影響嗎?請老闆大人提示~~~~謝謝 2008/08/29 送MGM定序SOP DNA 0.5-0.6 ug Primer 4 ul of 2 uM H2O to 8 ul 第一次做不出來若想不到明顯錯誤處可再送一次 2008/09/09 Lab Meeting 心得彙整 小嬿: 講得很清楚喔!知道已給妳太多paper了讀不完(sorry) 但是,可否,拜託,先讀一下這四頁知識,幫我們summarize 一下. 我覺得瞭解這篇以後,對往後妳和小丸子的實驗設計非常有用(才不會走錯路)因為這實在是太顛覆我過去的想法了! 2008/09/23 Lab Meeting 心得彙整小嬿: (1)BC- 1及P3HR1的fuctional assay真的很有趣. 看來gZ及cZ都有function.tZ大概真的是一個Z的suppressor.

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