(From google Groups/sflinlab2020) 成功收到第一份 來自 Guest Forum 的測試文。 早上一直找不到「建立群組」按鈕，結果先在 @gmail.domain 建立一個新群組，邀請 @g.ntu加入，就成功了 a reply mail from lab account also works 先到 https://groups.google.com/forum/#!newtopic/sflinlab2020 論壇區發表主題 就可以開始玩… 賴亭羽<b002010033@gmail.com> Jun 23, 2020, 9:17:18 AM to sflinlab2020 玩…網站? 所以要貼主題的意思嗎? SFL<sflin1@gmail.com> Jun 23, 2020, 9:50:31 PM to sflinlab2020 Yes, post whatever you wish to discuss, record, or show-off here.
Survival Outcomes in Cancer Patients Predicted by a Partial EMT Gene Expression Scoring Metric (PubMed Link) Jason T George, Mohit Kumar Jolly , Shengnan Xu, Jason A Somarelli, Herbert Levine Recent experimental and theoretical evidence suggests that cells can be stably halted en route to EMT in a hybrid E/M phenotype. Cells in this phenotype tend
The hybrid E/M phenotype of EMT 竟然與 collective migration有關 Read More »
被地震嚇醒，然後.. 找到知音了 一整個掃掉被地震嚇醒的擔憂，哈哈哈 原新聞連結如右 tinyurl.com/ya4ydkd3 The D614G mutation in the SARS-CoV-2 spike protein reduces S1 shedding and increases infectivity (bioRxive 06/12)Lizhou Zhang, Cody B Jackson, Huihui Mou, Amrita Ojha, Erumbi S Rangarajan, Tina Izard, Michael Farzan, Hyeryun Choe作者群名字看起來像中國人，其實是USA Scripps Research Institute # (old thought by SFL) 這個點與ACE2結合區離得蠻遠的，看得出來它自成一區，但卻無法猜出分子機轉。另外，D to G 似乎在演化上是理所當然之變… 06/15 原來要這樣講才對… https://youtu.be/Fvd-J1kIOYQ?t=31 # SARS-CoV2 # D614G
哎呦我的媽，醜醜的code見得了人嗎? Difference between R MarkDown and R NoteBook NoteBook多一個 .html檔，多麽邪魔 Daniel 太好了! 這一篇有望被接受! 我是安裝Gossamer bioinformatics suite (https://github.com/data61/gossamer)使用裡面的Xenome模組 (https://github.com/data61/gossamer/blob/master/docs/xenome.md) Xenome 我需要給一個workflow的 script file 裡面包含所有指令跟檔案路徑嗎? XenofilteR 應該可以直接給GitHub連結 (https://github.com/PeeperLab/XenofilteR) 對, 可以建立一個github account for this publication. 有兩種方式, 1, 直接fork (像給link, 可以追朔源頭) 別人的project, 2. 另外寫一套流程 python code for pipeline 把別人的程式碼放/包進來, 我之前都是一個個下指令, 沒有寫成腳本script 執行 這是我以前的github account …. :p https://github.com/danielsu0523 都是直接implement成web application, Epimolas有放在江博士的github上
Reviewer 3: It will be nice if you can share the codes… (CAF index MS) Read More »
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Reviewer 3: It will be very useful of you can share your codes… Read More »
CancerLinQ: CancerLinQ LLC is a not-for-profit subsidiary of the American Society of Clinical Oncology (ASCO) established for the development and operation of the CancerLinQ initiative.[1]. CancerLinQ is a health information technology platform aimed at enhancing and improving the understanding and treatment of cancer. This program was created to give oncologists a robust quality monitoring system
2019 ASCO Meeting-Caring for Every Patient, Learning From Every Patient Read More »
本屆大會論文競賽主題為「From Molecules and Cells to Human Health」 論文上傳將於 2019/01/18 23:59:59 截止 上傳連結 https://goo.gl/fFqrbo 大會官網: http://www.jacbs.org.tw/
第34屆生物醫學聯合學術年會 03/23–03/24 Read More »
FISS: Formosa Immunology Spring School & Symposium 2019 (Apr 12-13) [會議報名]尚未開放 預計2019年1月開放報名開放所有人士報名地點: 林口長庚紀念醫院歡迎加入Facebook粉絲頁”I-Club”，追蹤會議消息 [春季學校註冊資訊]報名資格:台灣生物醫學, 免疫相關學系之: A. 博士班學生; B. 碩士班學生; C. 博士後; D. 研究助理; E. 牙/醫學系學生; F. 牙/醫生; G. 其他任何修習過大學程度免疫學 (請於CV中註明)。正在或在一年之內曾在實驗室工作並取得實驗室主持人推薦信 (見申請文件)。入選學員需全程參與免疫學校活動以及國際研討會。報名日期: 2018年10月15日-11月30日 申請文件:完整填寫下載四份文件 templates (CV, Personal Statement, Research Abstract,Recommendation letter from Lab head)後, 請匯集儲存成一份PDF文件文件檔名應為: FISS_Last name_First name initial_分類(見報名資格#1)Example: Li-Fan Lu, Postdoc. – The file name
2019 福爾摩沙免疫春季學校與會議, FISS Read More »
想要分享下面幾點 Immunogenomics RIKEN: gene expression commons Deconvolution of gene expression data CIBERSORT: in silico flow cytometry The immune landscape of cancer Head and Neck RNA-seq analysis of cell line derived xenograft tissues OC3-NOG, TW2.6NOG, TW2.6-huMice <Slide Pdf下載連結>
2018/10/11 Journal Club Read More »
(新聞來源：中央社網站）微軟創辦人比爾．蓋茲（Bill Gates）愛讀書，他的書單經常成為書市話題，今年6月他做了一件以前沒做過的事：自掏腰包送給全美國大學、研究所畢業生一本書－－公衛學者漢斯．羅斯林（Hans Rosling）的「真確：扭轉十大直覺偏誤，發現事情比你想的美好」。其實在這本書出版前，比爾．蓋茲就罕見地搶先分享，又在夏季書單中再次推薦，他為何如此推崇這本書？ 比爾．蓋茲說：「這本書充滿了關於如何清晰地看待世界的建議。儘管我認為每個人都應該閱讀它，但對於那些正在從大學跳躍到下一個階段的人來說，它具有特別有用的見解。」他也希望大學畢業生能藉此學會真確思考，基於事實行動。