什麼是元旦連假?
誰能告知一下今年元旦假期怎麼放?我想挑一天實驗室大掃除/望年會/分享/進度報告…然而我桌面上待寫的有年終報告/新年度計畫/國科會計畫/癌研所考評報告… 到底什麼是元旦連假?怎麼放?如果我們把和美||元老師家的聯合望年會改成一月份好嗎?院內的是1/14星期三,而除夕是1/25星期日。還有,妙極了,第一次看到CO2間紅燈會亮!是349的功勞嗎?謝謝Ingrid(下次能在網誌上公佈一下更好)。 在sflin3 blogspot上貼文與灌水,是你我的責任與樂趣—放手寫吧、大聲說吧。
SFL
Microplate Vortex
有一個好理由說明不要用它來做trafsfection mixer:this machine serves up-down “micro” mixing. Yet, after well-vortex, it suggests you to do a centrifugation step, to bring down everything back to the bottom. Without this step, some HD/DNA mix may adhere on the wall of microplate.所以,辛苦一點,在eppendorff內做調配DNA/HD的動作吧!謹勉之。
祝福逸人當官順利
有空要多留言喔,告訴我們你很威風(或是相反)。分發時抽到能幫助你成長的籤。吃到不好吃的食物就立刻回想起在這裡的種種negative controls。志玲姐姐改走勞軍路線、胃疼不藥而癒、前途光明燦爛!
深思熟慮的Pol II (10/13 更新)
RNA Polymerase II Pausing 的延伸閱讀歷史背景介紹(before 2005):1986年Lis實驗室首先發現以chromatin immunoprecipitation (ChIP)偵測RNA Pol II在果蠅Hsp70 promoter(hsp70)的結合位點時,發現雖然還未被heat induction,但hsp70上卻已有Pol II binding.他們進一步以KMnO4 footprinting和nucear-run等解析度較高的技術算出,在未被heat shock的hsp70上 面Pol II結合位點集中在transcription start site下游20~50 nt附近(+20~50).這種RNA Pol II停在+1下游40 nt左右,而且不再往前polymerization的狀態稱為promoter-proximal pausing.因為hsp70被heat shock後transcript的合成的上昇速率高達100~1000倍之多,因此當初認為這應該僅僅是少數的特例之一.在mammalian cell中較為熟知的類似例子有三,分別是c-myc (1992), c-fos(2006), 和junB(2006). Pausing 的另一種含義是elongation受阻,在in vitro實 驗中發現,若加入positive transcription elongation factor b (P-TEFb)那pausing的現象可被大幅解除.P-TEFb是由cyclinT1和CDK9組成.其中CDK9扮演的角色就是 phosphorylate停滯在promoter-proximal pausing上的三種成份:(1)Pol II CTD上的Ser5 (不知道是不是52個repeat上的S5都會被modify) (2)negative elongation factor-DSIF(磷酸化後的DSIF反而變成positive ELF,會與Pol II緊密結合在一起,直到做完transcription後,一起跳海) (3)另一個negative ELF complex叫NELF(由A,B,C/D,E四個subunit組成,磷酸化後的NELF會掉下來,是一個正港的negative elongation factor!) 病毒界有兩個蛋白質是透過與CDK9結合/增加Pol
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Primary infection of EBV in keratinocytes – the history
2006/10 Molecular and cytogenetic changes involved in the immortalization of nasopharyngeal epithelial cells by telomerase (the link to NCBI) 2008/10/10 這一篇.所以送EBV進入NP460h-hTERT不就等同於把EBV關禁閉? Dr.George Miller有篇在J.Virol.Methods(2006)的文章,看起來像是一位MD/PhD的學生做的。他以兩位IM病人血清(富含各種anti-EBV抗體)去分離經NaB處理過的P3HR1(HH514)細胞。分什麼呢?分那些在走lytic cycle和不被NaB活化的HH514。分下來後的細胞再送回去petri-dish養。結果發現走lytic cycle的細胞無一存活、而沒有induce的細胞可以再被養回來,而且induction rate隨著時間增加而增加。很有意思的一篇文章。George大學是學歷史的,非常會寫文章,邏輯性很強而且要言不贅,讀他的paper總覺得能做science真好。 2010/02 MTA_Signed_LinSF_NP460hTERT 2010/08 Epstein-Barr virus infection in immortalized nasopharyngeal epithelial cells: regulation of infection and phenotypic characterization (the link to NCBI) 2012/06 AC944 Primary infection of akata-EBV in NP460hTert
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hTERT抑制EBV複製及For Phil文章一篇
2008/10/10_hTERT抑制EBV複製及For Phil文章一篇由 sufang 在 五, 10/10/2008 – 16:40 發表 Older Posts EBV NP460hTERT 2008/10/10_hTERT抑制EBV複製及For Phil文章一篇 由 sufang 在 五, 10/10/2008 – 16:40 發表 Older Posts EBV NP460hTERT 這一篇.所以送EBV進入NP460h-hTERT不就等同於把EBV關禁閉? Dr.George Miller有篇在J.Virol.Methods(2006) 的文章,看起來像是一位MD/PhD的學生做的。他以兩位IM病人血清(富含各種anti-EBV抗體)去分離經NaB處理過的P3HR1(HH514) 細胞。分什麼呢?分那些在走lytic cycle和不被NaB活化的HH514。分下來後的細胞再送回去petri-dish養。結果發現走lytic cycle的細胞無一存活、而沒有induce的細胞可以再被養回來,而且induction rate隨著時間增加而增加。很有意思的一篇文章。George大學是學歷史的,非常會寫文章,邏輯性很強而且要言不贅,讀他的paper總覺得能做 science真好。
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又到週末了
那麼,祈願美國經濟不可崩盤,歐盟諸公繼續挺台灣入衛,台灣八點檔連續劇恢復一個鐘頭,青菜水果價格恢復…（喂喂喂,大家多多開文啊,這裡是”Our Thoughts”~寫了不愛還可以自己消掉啊.也許大家都忙著做實驗吧,看來當老闆還是不錯的)下週二Lab meeting時,小嬿要報告RNA Pol II pausing的paper(rehearsal).現在請各位捫心自問:R/Z這些傢伙是怎樣幫忙RNA Pol II做病毒基因轉錄的?
歡迎新作者
拍拍手,我們歡迎你,旻潔!(確定不用藝名嗎?)(又,依據老鼠會原則可否請把Sheng-Yen的email給Reactivation(sflin3@gmail.com)我等他過一陣子較不忙時再邀他加入作者群). Many thanks, and again, welcome!