Wishing List for FPKM analysis
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#2由 sufang 在 六, 05/09/2015 – 20:02 發表。Reviewers CommentsReviewers Comments From PLoS Pathogens (06/20–0/7/31, 6 wks) Reviewer #1: This is an interesting manuscript in which the model is advanced that EBV and KSHV Rta by binding to their respective genomes, induce local methylation which promulgates lytic replication and dissociation of CTCF, which is inhibitory to
Rta/CTCF MS related Read More »
2/27(四)合作討論會議: BGJ398 A2204 cholangiocarcinoma study #1由 sufang 在 三, 04/09/2014 – 12:08 發表。 Norvatis人員的報告摘要 1. K650E in FGFR3 mutation is also sensitive to BGJ398. 2. Dan/YiMi的paper是K652E對PD173074無效。 3. TKI258不知道是啥…有點失憶!
FGFR fusion related Read More »
由 sufang 在 一, 07/29/2013 – 20:10 發表 Pre-published 40 T/N ECM KEGG Microarray Stiffer: Up in COL, LAM, FN, SPP1 (OPN), TNC, AGRN, IBSP (BSP), LOX, LOXL1, LOXL. ITGA3/A5/A6/B3/B4/B6
一則以喜 (表示我愛的秋冬快來了),一則以憂 (表示要寫一大堆報告和計劃的季節快到了) . 放下又喜又憂的未來不講,我要與大家分享最近一些頭頸癌的大paper: (1)務必上網聽聽2012/11這個網站的第11個talk. 講者Dr. David Hayes是UNC的MD/MPH. 繼這個symposium之後,今年4月AACR abstract 1117 /PressConference 以及之後6月份 Oncology Times都又陸續添加他發表的相關結果。 重點有二,(1) HNSCC 和Lung SCC的genomic mutation landscape具相似性。並且可依expression profile把HNSCC分成四個subtype: basal (BA), atypical (AT), mesenchymal (MS), classical (CL). HPV+ve的sample多落在atypical type. (2) HPV+ve 和 HPV-ve在許多molecular signature上都不相同。TCGA把這種paper叫”marker paper”. Lung SCC的marker paper在去年9月出刊 (連結)、HNSCC的應該快要出來了(279位病人)。 (2) 作者本身是UNC的醫生,這個group 他們在二月份PLoS ONE也發了一篇marker paper (138位病人) (連結) . 然後文章中又與他們在2004年的Cancer Cell(60位病人, 連結) 做比較。
逛啊逛的竟發現同一期有篇二個圖的paper、而且是Lung SCC中FGFR3-TACC3 fusion. 天啊,斷點與我們的一模一樣… (點我下載)。
FGFR3-TACC3 Gene Fusion New Paper Read More »