SFL

心得彙整暫存區

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2008/09/03 Lab Meeting心得彙整 1.一週三天有固定時間不能做實驗,會不會太沒效率了?來和與星期二下午的大瞇合辦怎麼樣? 就是說當天不在大瞇報的二個人就在小瞇報. 小瞇就排在大瞇前一小時,也就是一點或一點半和SFL討論.這樣一來平均每種meeting(被瞇得昏昏欲睡了吧)就是二個星期報一次. SFL昨天確實有被擊垮的感覺 （還是太久沒好好靜坐了?）2. RAZ 最早是小Kenney和飄魄的Pagano發現的.這個實驗室和英俊的Sergeant有進一步探討 3. Transcriptional activation 與 轉錄因子phosphorylation 正相關之例子搜尋4. 低溫長時或高溫短時對GST-N600/GST-Q658之水溶性影響, KR OGlcNAc 最後一張圖待補5. CKI與老化 (ERKV與PI3Ki/CKI) 6. Failure in 293/green EBV (DNA from ingrid or CGU) 2008/09/16 Lab Meeting 心得彙整 CCL:亞硝胺stock分裝成小包裝,每次拿一瓶aliquot出來用,用完即扔不重複使用. 請再做一次Dox (5 ng/ml) alone,24~72小時的提引(若細胞夠再加入亞硝胺部份(0.05 ug/ml)的實驗組). 預期的EAD expression kinetics 請參照白板上心瑋/小嬿之powerpoint列印檔.謝謝. 2008/12/02 Lab Meeting 心得彙整 Team-work部份結果已出爐, 正商請李老師幫忙分析中。綜合目前western結果,小丸子的二批檢體都有 wash-off現象,小蓮的檢體正以EV、KV downstream protein來確定標示問題。等確立完成後再來萃取RNA。Ingrid的兩批則較沒有wash-off現象,原因不明。另一批要抽RNA的檢體是沒有 dox的control。小結:Team-work–>Perfect!看來我們會得到一張相當不錯的地圖的。很振奮耶,米那桑。 2008/12/16 […]

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關於CCND1 promoter

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關於CCND1 promoter由 EVKVLIN 在 二, 04/01/2014 – 14:52 發表 EBV and KSHV CTCF Rta senescence03/25/2014 Dear 嬿如， 昨天張堯老師來電說第一次做出來的DAPA結果竟然與他們預測的不一樣 -> Rta binds to both the wild-type and the RRE mutated probes!所以我與他要了sequence來看看可能的解釋是什麼. (上次K156A的結果，有測CCND1嗎? Rta是直接結合到這個promoter上嗎? thank you)———————03/26/2014Dear Dr. Lin, 上次K156A的結果在CCND1上也不是很明顯(EREV8中wild type : K156A= 0.7: 0.76, 而在ERKV中為0.87: 1.21) (如附件Fig.1) 在CCND1 promoter上的potential RRE, 我是用5′-GNCC(N9)GGNG-3’預測出來的在張堯老師所設計的probe片段中沒有其他位置有GNCC(N8-N10)GGNG或是CC(N9)GG等選擇但是DAPA結果顯示Rta還是bind此段序列, 所以我猜core element的條件可能要更鬆一點我試用另一個序列來預測RRE(如附件Fig. 2)用interval region為8 bp的motif來搜尋probe片段, 則會發現CBS上可能有potential

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寄送RNA給高醫黃道揚醫師

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由 ingrid 在 二, 04/01/2014 – 13:03 發表 Cholangiocarcinoma FGFR fusion 高醫 黃道揚 Dear SF, My mailing address is:高雄市三民區自由一路100號5F腎功能室. ———————– SFL1=988 ng/ul C9 RNA 15 ug = 15ul (希望他能訂出FGFR3-TACC3) SFL2=792 ng/ul SW780 RNA 15 ug = 20ul (希望他能訂出FGFR3-BAIAP2L1) SFL3=1100 ng/ul TW2.6 RNA 15 ug = 13ul(希望他訂不出任何FGFR3 fusion) #1由 sufang 在 五, 07/25/2014 – 11:29 發表。 7/24 黃醫師來函 Daw-yang Hwang

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OrCa小組會議_DOK related

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由 sufang 在 四, 03/27/2014 – 00:00 發表 Oral Cancer Arecoline DOK nicotine NNK OrCa小組會議 (03/27/2014) 素芳的筆記本： nicotine: 500 uM NNK: 10 uM arecoline (AC): 50 uM or 100 uM treated for ~ 1 year, looking for carcinoge-tolerant cell clones, eg. NNK4, NNK5, NNK6, NIC4, NIC5, NIC6 doubling time migration assay In vivo tumorigenesis Expression

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LabMeeting-小丸

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LabMeeting-小丸由 EVKVLIN 在 二, 03/25/2014 – 00:00 發表 LIN Lab 2016 LabMeeting maruko 小丸2008/09/09 Lab Meeting 心得彙整 Maruko:要不要考慮這個跟這個,還有一個這個. 另外S186A是一個至今仍然未解的有趣mutant. 它可以bind DNA,可以transactivate一些promoter,有被訂出in vivo是被PKC磷酸化,但似乎此位點磷酸化的有無與disrupt latency無關.所以此例子並不適合追太久.. 2008/09/16 Lab Meeting 心得彙整 Maruko: (1) 為確保293TetKR中仍是每個細胞均具有transgene,小丸子成功地以flow demonstrated that, although weak, but Dox treated 293TetKR homogeneously shifted the anti-flag staining (1:50) to the right (not seen in 1:100 staining). 這樣子的結果可以讓我們安心的繼續使用這個細胞株.當初其實很怕是部份細還有KR,部份細胞則沒了,而以immunoblotting 又分不出來,所以小丸子勇猛地做這個實驗(熱烈鼓掌 霹靂啪啦 霹靂啪啦)智者常言:打鐵趁熱,所以讓我們也篩一下ER.能否請小蓮協助/學習小丸子把手中的293TetLuc及TetER也做一次這樣的實驗,我猜KR不幸是最弱的表現者.

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Rta/CTCF MS related

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#2由 sufang 在 六, 05/09/2015 – 20:02 發表。Reviewers CommentsReviewers Comments From PLoS Pathogens (06/20–0/7/31, 6 wks) Reviewer #1: This is an interesting manuscript in which the model is advanced that EBV and KSHV Rta by binding to their respective genomes, induce local methylation which promulgates lytic replication and dissociation of CTCF, which is inhibitory to

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FGFR fusion related

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2/27(四)合作討論會議: BGJ398 A2204 cholangiocarcinoma study #1由 sufang 在 三, 04/09/2014 – 12:08 發表。 Norvatis人員的報告摘要 1. K650E in FGFR3 mutation is also sensitive to BGJ398. 2. Dan/YiMi的paper是K652E對PD173074無效。 3. TKI258不知道是啥…有點失憶!

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