Lab Meeting

Biomax tissue microarray informations

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Dear老闆: 這是tissue microarray的網址 http://www.biomax.us/tissue-arrays/Head_and_Neck/ 我挑了一下 (case多及有附normal control的) Bladder: BL2081 (203 cases) US. 455 BL802 (80 cases) US. 255 (兩片有60個cases重複) 建議買BL2081 Head and neck, oral cavity: Old: OR2081 (98 cases) US.455 (仍有trial等級 US.150) BC34011 (24 cases) US.140, HN811 (27 cases) US.215 New: HN483 (48 cases) US.165  (與OR2081有1個cases重複) HN803a (80 cases) US.255  (與OR2081有4個cases重複) 建議OR2081 trial等級+ HN803a 給你參考              

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20140115 Lab meeting-小丸子

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1. 整理與Harvard Skin Disease Research Center Dr.Rheinwald購買之細胞株培養方法 2. 試著釐清Src與DDR1的活性之關聯性: 過去研究指出(1)Src innibitor會抑制collagen I induced DDR1的活性(2)Src會與p-DDR1有交互作用 我的結果指出(1)imatinib處理會抑制Src的活性 (2)比較不同株細胞Src的活性與DDR1的活性似乎有相關 (3)加入Src innibitor會影響OEC-M1中DDR1與Src的交互作用(此現象在TW2.6不明顯) (4)加入Src innibitor 對於OSCC細胞生長的抑制影響不是很明顯(1uM濃度, 48小時) 3. 整理過去發現Collagens處理後DDR1,ITG..等mRNA level增加的例子, 結論為大多條件均在serum free下進行, 因此會嘗試改變為這樣條件去觀察在keratinocytes中處理Collagens對DDR1及ITGs mRNA level的影響 4. QPCR的CT值差異約要載1.5-2以上 以終產物跑agarose gel 才看的出來差異

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2013/12/11 Lab Meeting- 小夏

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A. IP結果1. AE316: 1) KR跟DNMT3b有很強的interaction; 2) ER/gZ跟三個DNMT都有interaction。 2. AE326: KR跟DNMT3b有interaction, ER沒有; ER與KR和DNMT3a都有interaction (雖然ER大於KR, 但KR本身的量也較少, 若補回來可能差不多)。 3. IP將Focus在DNMT3a與Flag-Luc, ER, KR間的Interaction情形。 B. To screen IFNG induced-IDO1 expression 1. 各個OSCC細胞間的IDO1表現應好好的跑在一起公平比較，在AE324中無法下定論。 2. AE324: IFNG can induce IDO1 expression in OSCC cells. 3. AE342: 參考Dr.洪明秀實驗室Wenchy的實驗方法，觀察OSCC在IFNG處理之下的細胞狀況(e.g., Cell rounding, Cell arrest, Cellular senescence, Cell death).

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09/18 Lab Meeting

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小羊畢業口試rehearsal! ——– 意見彙整:Major Comment:1. 不要對著螢幕解釋抄來的英文內容，這是論文口試、不是即席英文翻譯。試著把英文二行以上的句子縮短微小於二行、或是直接改成中文。另外要時時看一下聽眾的反應。2. 要打講稿，注意大約一分鐘一張slide。3. 覺得不好講的地方要用圖表幫忙。4. Introduction 是不是改成 口腔癌–> Gene Fusion–> FGFR3 –> TACC3 會不會比較順? (或許論文也應該這樣子編排比較好。不過別擔心，有了「Insert目錄後」，改那個很快)5. Cell Line 名稱要做個簡單的表格、在需要的地方帶出來，因為不做這個題目的不熟這些cell line, 會不知所云。Specific Comments (slide number 可能會差一、二號):Slide 1 :頭頸癌的skin若發生病變應屬皮膚癌而非HNSCC. 1982到2013才上升一位，不能叫做一路攀升。應強調男性發生率及癌症死亡率即可Slide 3 (cartoon of FGFR3 signalling pathways): 明明是五個箭頭、為什麼你卻說四個pathway?Slides 3 & 4: tyrosine kinase domain 要指對地方。Slide 8: 英文有錯，考慮用中文。Slide 10: 圖扭曲得很難看.  TMPRSS2 是 protease? 那保留甚麼功能區? 圖A和C不同點在哪裡?Slide X (結果第一張) 要附 F3-T3、抗體、shRNA位點的示意圖，而不是一直對著空中指指點點。Slide

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