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4/27 Lab Meeting-ingrid

(1) 以shLuc、shOGT的lentivirus (稀釋倍數1/8) 送入ERKV (2.4×10^5/ml/well/12well) 中,24、48、72小時後,收lysates進行WB確認目標蛋白質的確有減少,A1效果比D1好。shLuc的lysates中,OGT的表現隨著時間增加而增加(?)(但Tubulin也隨之增加?)。 (2) 以shLuc、shOGT的lentivirus (稀釋倍數1/8) 送入ERKV (2.4×10^5/ml/well/12well) 中,48小時後加Dox,再48小時收lysates進行WB確認,因結果難以得出結論,故重新hybridize with OGT Ab。 (3)以shLuc、shMGEA5、shOGT的lentivirus (稀釋倍數1/8) 送入ERKV (2.4×10^5/ml/well/12well) 中,24小時後加Dox,再72小時收lysates進行WB確認,似乎引起的lytic reactivation沒有差異或看不出關聯性(與之前做的結果不一樣)。

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3/30 Lab Meeting-ingrid

(1) 以shLuc、shMGEA5的lentivirus (稀釋倍數1/8) 送入ERKV (2.4×10^5/ml/well/12well) 中,24、48、72小時後,收lysates進行WB確認目標蛋白質的確有減少,B2效果比D2好。shLuc的lysates中,MGEA5的表現隨著時間增加而增加(?)。 (2) 以shLuc、shMGEA5的lentivirus (稀釋倍數1/8) 送入ERKV (2.4×10^5/ml/well/12well) 中,48小時後加Dox,再48小時收lysates進行WB確認,MGEA5減少最多的B2,所引發的lytic reactivation越強烈。加入Dox也會引起MGEA5表現增加(?)。總之,將D2提高至1/4,再加入2個NC(有shRNA但未加Dox),重做一次。

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3/16 Lab Meeting-ingrid

(1) Dox誘導型細胞株的選殖TW05TetLuc:#1-6測試中TW05TetER:#2-18的WB有認到ER,重新做IFA以確認表現蛋白質的比例及強弱TW05TetER/gZ:#1-33測試中(2) 以SK-N-SH cell、HelaTet、TW03Tet及TW05Tet lysates做OGT Ab的western analysis,用黃老師家的goat二抗,沒有認到目標蛋白質,重買OGT Ab。(3) 以shLuc、shMGEA5的lentivirus (稀釋倍數1/8) 送入ERKV (2.4×10^5/ml/well/12well) 中,24、48、72小時後,收lysates進行WB確認目標蛋白質的確有減少,B2效果比D2好。

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2/23 Lab Meeting-ingrid

報告進度(1) TW05TetER:#1-18中,除了#1及#12以外,其餘在IFA中,為FLAG Ab陽性,重複做IFA(點片)以重複確認。(2) 以SK-N-SH cell lysates做OGT Ab的western analysis,覺得沒有認到目標蛋白質,再以Hela cell lysates當positive control及黃老師家的goat二抗再確認。

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1/26 Lab Meeting-ingrid

報告進度 (1) TW03Tet:因挑選細胞株TetR表現差,故重新挑選。TW05Tet:以#4進行接下來的穩定細胞株篩選 (#3、#4及#6送入液態氮),包括Flag-Luc、Flag-gZ+Rta(1:3)、Flag-Rta (2)以shLuc、shOGT、shMGEA5的lentivirus (稀釋倍數1/8) 送入ERKV (2.4×10^5/ml/well/12well) 中,24、48、72小時後,收lysates進行WB確認目標蛋白質是否有減少。 (3)以SK-N-SH cell lysates當作OGT Ab的positive control,同時確認goat二抗是否可用。

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12/29 Lab Meeting-ingrid

報告進度(1) TW03Tet有10株細胞株,TW05Tet有8株細胞株,已凍管且收好cell lysates等待Western analysis確認。 (2) 目前要進行的實驗如下a. 將不同稀釋倍數(0、1、1/2、1/4、1/8、1/16)的pAS-EGFP lentivirus送入293中,48小時後,計數細胞存活及死亡比率,同時跑FLOW。(這次infection時,不從細胞上移除含有polybrene的medium)b. 以shLuc、shOGT、shMGEA5的lentivirus送入ERKV中,24、48、72小時後,收lysates進行WB確認目標蛋白質是否有減少。c. 將OGT Ab的條件抓好。

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12/22 Lab Meeting-ingrid

報告Hart新作:(1) 以chemoenzymatic assay及抗體確認histone有O-GlcNAcylation(2) 以LC MS/MS定義出histone上有被O-GlcNAc修飾的位點:Ser47 of H4、Ser36 of H2B和Thr101 of H2A(3) Heat shock(45℃,1hr)及後續的recovery的時候,發現histone的O-GlcNAc程度逐漸提升,同時OGT活性也有緩慢上升(4) 以MNase chromatin-sensitivity assays檢測發現Heat shock及後續的recovery時候,Chromatin(染色質)會condense(5) 過量表現OGT會比過量表現GFP的細胞的染色質更加condense

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11/10 Lab Meeting- ingrid

1. 想要測試Dox對TW01Tet的生長是否有所影響,結果失敗。下次要收短時間測試(如1、2、3天)。 2. 篩選TW03Tet及TW05Tet細胞株。TW03Tet:24株裡有19株長起來;TW05Tet:24株裡有12株長起來。目前皆放在6 well內等待Western blot測試TetR。 3. OGT抗體無法辨認抗原,已重新購買。另外要解決internal control在每個sample中的量皆不相同的問題。 4. 將shMGEA5送入ERKV細胞中,”似乎”可以使發紅光的細胞比例上升,要再進一步詳細確認。

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09/29 LabMeeting ingrid

報告去英國參加EBV研討會的感想 針對我的POSTERDr. Tsao提出以下的問題1. TW01TetEREVp2089是否產生具有感染性病毒顆粒?(目前無)2. 有考慮送入Zta做stable clone嗎?(Rta在epithelial cell內比Zta更能夠活化EBV溶裂期)3. senescence與lytic cycle的關連?(以下簡述SEL在噗浪的發言 謝謝SFL:)Senescence大致分兩類,一種是replicative senescence就是telomere越來越短的”自然老化”; 另一類是oncogene-induced的senescence簡稱OIS.我們Rta造成的senescence屬第二型.) 另外報告1. Dr. Shannon C. Kenny的海報中,提出Na在上皮細胞中會與p53一同誘導lytic protein表現2. Dr. Tsao的海報中,他們建立了HONE1-EBV、HK1-EBV及NP460htert-EBV細胞株,其中前二者可以產出有感染力的病毒顆粒。送入EBV的方式則是用Akata 細胞株進行cell-to-cell contact方式進行,成功送入EBV的細胞會發綠光,再以TPA加以誘導使其進入lytic cycle以產生病毒。還有說明加入TPA,雖然細胞的綠光會變強,但並不表示一定會產生相對應多的病毒。

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新年快樂-PARTII

SORRY剛剛手按太快就送出了沒關係就祝大家新年快樂加倍送 今年多了新成員–小丸子+小嬿實驗室人氣強強滾每天做實驗都覺得很熱鬧很開心 希望今年大家都可以狂發PAPER(我也要加油!)而我要學習SFL的組織功力盡量讓我的周圍乾淨整潔這就是我的新年新希望 最後祝大家牛來運轉發大財

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