Paper(PNAS Early Edition)的檔案
SFL你好,麻煩你把昨天給我的paper之pdf檔寄到我gmail的帳戶(就是我註冊網誌的信箱),可能比較好收信。謝謝。
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細胞老化和病毒再活化
這部份實驗是承接293TetER之後的故事,我希望剛開始的一些結果可以當做小嬿的論文。小蓮請先協助,小丸子與Ingrid在忙完KR後也要漸漸加進來,希望能夠把這部份的因果關係釐清清楚。以EREV8而言雖然和293TetER所表現flag-ER的量是相似的,但是因有病毒基因套在裡面,所以估計還不到SA-b-Gal最強的第十天,細胞可能因病毒大量製造的摧殘就掛了。ERKV可能也是如此。所以,我們要弄清楚什麼呢?⓵Dox-treated 293TetER停在G1,那有病毒的細胞呢?⓶Dox-treated 293TetER在serum-free這個stress存在下細胞巨觀並未如對照組產生顯著變化,而且病毒再活化時,在48小時以後細胞明顯變圓。再來,microarray顯示Rta或Rta+EBV或Rta+KSHV均會讓一群控制細胞架構的基因表現異常。另外,小龜的結果又顯示ER一表現可持續活化Erk(一個和cytoskeleton有密切關連的分子),這些線索之間相互間的關係到底是什麼?⓷Dox-treated EREV8和ERKV有走完裂解期嗎?製造出來的病毒有感染力嗎?效價好嗎?(小嬿你真的要準備吃大餐了)⓸另外幾組異常表現的基因如DUB/protease,chromosome binding protein等,如何和老化及病毒再活化連起來呢?⓹細胞老化已知的pathway(growth arrest, activation of mTOR, secretion of mitogenic/antiapoptotic factor, activation of proteosome)可提供病毒什麼好處、讓它引發lytic cycle?
待辦事項
Special Issue on AgingCDK9 and protein stability (Pubmed search WHT: set 1 Inhibitor 2, Dox 3; set 2 Inhibitor 5, Dox 2)si-Paper for小蓮,這裡。 玉蓮檔案fetch自製年曆 Copy this to excel.Milestone in cytoskeleton.
實驗室工作分配(初稿)
小丸子:OrionL、PCR儀器前公用區域、細胞間、咨詢。Ingrid:管帳、庫存採買、CO2/LqN2、化安、團購、同事間感情維繫。小蓮:生安、lightbox前公用區域、協助管帳及庫存採買。小嬿:藥品間、protein bench、new idea引進、發問。以上分配是可以喬的,若覺得太多或沒有分配到你的天生強項,請務必留言告知。買東西方面還是跟往常一樣,多問、多想。購買時的登錄、貨到達時的簽收、datasheet歸檔等好習慣,大家要繼續保持。 新年度開始,建議大家訂閱Nature中文繁體版。每週四讓它帶給你最酷的新知!方式：啟用你希望寄達的email帳戶,開啟一份新mail,收件人處貼上下列住址,naturehcontents-on@mail-list.com餘皆空白,然後按send就成了。若看了不愛,只要找到mail最下方unsuscribe的連結,也是寄出一份空白信就okay了,神不知鬼不覺地…另外歡迎大家詢問MyNCBI, RSS如何訂閱及使用等小撇步。工欲善其事必先利其器,我們千萬不要輸在起跑點… 最後是下星期三(1/14)吃大餐前一、二個小時,我們得撂起袖子,好好地把灰塵請走(書桌上的、櫃子上的、儀器上的、bench上的)。另外去年買了一罐碧麗珠放在paper cutter旁,也請多加利用。多勞動一下晚上的飯菜必定更加香甜〜 ps各區域負責人有任何”規矩”希望大家遵守的,請隨時提出來,謝謝。
Bye~2008!
話說老灰阿SFL是不太過新曆年的，因為農民曆(各廟宇均免費提供，這裡也有)好日子壞日子推算之精準,是令我著迷、捨陽就陰的最大原因。於是我的題目應是Bye~little mouse! Little mouse年我們實驗室有了學生，有了post-doc，終於稱得上是轉大人成功。在基因層面上，我非常感激Jackie，JYChen， JYChang，及KW的支持。在外型表現上,我要謝謝小嬿及小丸子的加入，還有各個邀我當他們論文committee的老師與學生。這樣一來再加上原有的英蓮二傑，所以在這一年年底我們成功地把第一份論文推上Pubmed！這裡還要請大家原諒我的任性，如果Cell Cycle到6月份新的JCR出來點數還是只有3~4,我還是會繼續挺它的-直到它的簡捷、是非分明、少政治味、勇於挑戰主流思想的氣質消失為止…（咦，跳tone了請接→）所以本實驗室中的學生要畢業、博士後要找工作、老闆要幫忙學生和博士後並且維持實驗室的正常運作不會被令歇業、而助理來協助老闆達成目標。每個人各司其職、卻又彼此之間環環相扣→按吶講、你講好不好啦。 Little mouse年我們發現Rta會造成細胞老化，而且也促成病毒reactivation。從microarray data我希望能找到、描繪出這兩項過程有無關聯。Chance是很大的，因為許多促成老化的生化過程，「感覺起來」和病毒活化所需的過程非常相似，所以放在你們桌子上的計劃書就是寫這部分實驗到目前為止的進度與想法。另外，雖然over-express KR細胞沒有太多變化，但是在little mouse年我們也確定KR的糖化與磷酸化對它的活性有影響。因為糖化與磷酸化對其它細胞轉錄因子活性的調節，都被報告得好像很重要，所以，多讀類似文章、深入各種機制、學說，是把它們推銷出去的最好辦法。這也是我們新年的第一、二要務。 財務方面、實驗室整潔、各項運作則要謝謝大家一年來的幫忙(尤其是Ingrid)。各位的分憂解勞讓我覺得當老闆還真是幸福啊！不過為了達到一流實驗室的目的，我們來年還是有進步的空間，這方面會另外闢文討論 。最後是祈禱bull year大家身體健康、智慧增長、有好玩的事情發生！
2008 我畢業勒 (小丸子)
還記得我打開II網站 看看我已經revised1個多月的paper..突然看到 ACCEPTED…我跳起來 抱住助理 心想我終於可以畢業了..一把鼻涕 一把眼淚 打給我老媽午覺正甜的的媽媽 以為我被綁架哩..((她被詐騙集團騙過))…原本停滯的博班生活 一下子忙碌起來..所以 於2008年3月14日…我終於口試了..那天 林以行老師 還開了一瓶 粉紅色的香檳 幫我跟嘉玲慶祝…接下來一陣子 走路都會傻笑…..(((因為很開心 我終於唸畢業啦……))) 我回了高雄 過了一陣子陪媽媽買麵包的日子覺得超級幸福的… 然後 一轉眼 就來到 什麼都挑高的 國衛院啦這裡是一個很是一個作實驗很優的環境加上 這個實驗室的老師 同事 學妹啊 人都很好我好像沒什麼好抱怨的…..呼呼 我只適應了一下下 就覺得 很喜歡啦…希望 來年 整個實驗室順利 paper大發….旺旺旺!!!
小龜祈願文
我在台北，但我絕對離好命很遠很遠，明天能放四天假，已經讓我感恩到想痛哭流涕了。看起來我寄的卡片有順利地到達，我自己覺得三張卡片一起寄真是非常聰明的決定，感謝素芳老師！2008年剩下不到十四個小時了，也要來「懷舊」一下……年初的時候是怎麼想的？我忘的差不多了，但大多是關於實驗的雄心壯志吧，但好多事還是沒有完成，本來的未來預想圖讓一個已伏筆了許久了「想不到」而打亂了，今年最大的感嘆就是：人算不如天算，天算不如不要算。今 年能平安的渡過，真的該感謝很多人，在竹南的嬿如學姊、玉蓮學姊和超級厲害的素芳老師，謝謝你們願意聽我胡言亂語；在台北的EBV group中的學長姊和學弟妹，感謝你們沒有因為我老是瘋瘋癲癲，就把我踢出去；還有各位寬容又厲害的老師們，託大家的福，讓我領到一張可以出去混吃騙喝 的文憑，感恩到五體投地！三叩首！明年，我有很多小小心願想要達成，第一個小小心願正在努力中，希望能如願，拜託拜託，各路神佛，請給我多一點點好運……第二個小小心願是，我希望我能做出我會喜歡的好data。第三個小小心願是，我要勇敢一點，要更努力一點，要更有效率的過每一天。第四個小小心願是，不要再有人叫我哈利波特啦！我一點也不像啦！(很認真的說)第五個小小心願是，希望所有人都平安健康！
回顧2008
跟蔡小丸說好一定要寫心得的~ 所以上來乖乖寫~ 嘿嘿 恩~2008年, 我要感謝挺多人的, 雖然我還沒做出個什麼有貢獻的事情出來可是~ 我要把預計要做的東西 全部做出來~!醬才有人會叫我 “超˙人” 這是我2009年的新年新希望! 哈哈哈 今年我惡搞了一堆data,跑了長得像心電圖的Western, 還有突然band歪一邊的gel,還有一堆不能reproduce的結果還有謎樣的p21, p27, 我永遠搞不懂他到底是上升還下降希望2009不要再出現這種東西啦~ 新年新希望part 2 每次跟學長們和SFL講實驗的事情, 都不由得很羨慕感覺就是真的飽讀詩書ㄟ~ 是要怎麼把哪一個lab做出什麼東西,還在哪一年發在什麼journal上都記起來?希望我以後也能這樣~ 新年新希望part 3 也感謝遠在台北的敏敏小朋友, 還寄卡片給我的小龜小朋友還感謝各位仁兄 容忍我的沒禮貌阿~偶而口氣很衝都是無意義的ㄚ~ 不好意思~ 請原諒我阿門~ 希望明年也能聽到很多”恩~很棒!” 祝 大家新年快樂 事事順心^O^~
暑期生推甄情形
真是恭喜她們!—————————————————————老師妳好: 我是淑華，告訴你三件好消息，我們三個都考上了研究所，感謝你先前為我們所寫的推薦信，我們考上的學校分別為－－彥君是中央大學的生物資訊與系統生物研究所，佳足是屏東科技大學的動物疫苗科技研究所，我是逢甲大學的生醫資訊暨生醫工程碩士班，那段暑假時光，感謝妳的教導和照顧，謝謝老師。(12/24/2008) —————————————————————-10/23/2003 SFL wrote:暑假來的三位暑期生報考研究所情形:陳彥君(中正資訊工程,中原生物醫學工程,中央系統生物與生物資訊,元智生物與醫學資訊)、吳淑華(中興資訊科學與工程,東海資訊工程與科學,逢甲生物資訊暨生醫工程)、陳佳足(長庚資訊工程,屏東科動物疫苗科技研究所),報給各位學長姐知道一下!他們是認真的耶,我們怎可懈怠! 補充:亞洲大學 楊宗泰老師曾在本院資訊組任職過
新聞二則
Cell秉持知識共享的高尚情操,真是令人敬佩。請按這裡。 看來,我的消費卷只好用來圓滿一個法鼓山的5475了(國衛院R2-1211病毒實驗室)。真是感慨呀,凡事都要冷靜思維,不要火燒功德林!