10/16 Lab Meeting
參加中研院NRPB/NGS研討會，Lab Meeting暫停ㄧ次。
09/25 Lab Meeting- 小嬿
Progress report 1. 比對RRE與CBS的差異. RRE的序列可能為16~18 bp, 主要由兩個core element(GNCC和GGNG)和中間間隔的8~10個nucleotides所組成. 若以分析RRE方式分析CBS, 可發現CBS與RRE的序列組合有高度相似性, CBS也有兩個core element, 差別在於隔開core element的序列只有7個nucleotide.–> Rta是否可能透過結合在類似CBS的DNA序列干擾CTCF對基因表現的調控.–>> 注意CpG, RRE, CBS相對位置 2. 觀察在EREV8和ERKV細胞中, Rta所調控基因的蛋白及RNA表現量的改變. EBV Rta在Dox誘導表現之下, 可在3小時被偵測到; 而細胞週期調控蛋白c-Myc和CCND1在Rta表現3-6小時表現量下降; p21及14-3-3σ在6小時表現量上升; 病毒溶裂期蛋白則在12-24小時才有明顯的表現量產生. –> Rta表現後改變許多細胞周期相關基因的表現, 而這些基因的promoter或intron上有CBS存在. 3. CTCF 可能扮演壓制EBV或KSHV不能進入lytic cycle複製的角色. 若外送質體表現較多的CTCF於細胞中, 可以發現EBV和KSHV的溶裂期蛋白表現被抑制, 細胞中的病毒DNA套數減少; 相反地, 以shRNA方式減低CTCF表現量時, 可以發現EBV和KSHV病毒的溶裂期蛋白表現, 並且細胞中的病毒DNA有增加的趨勢. 4. Rta結合於DNA上的功能對於基因的調控是重要的. 外送EBV Rta的DNA binding mutant(K156A)進入細胞中, 可以發現Rta原來調控的基因, 在K156A組別中的反應都較小. 5. EBV Rta結合到DNA上讓CTCF無法穩定地坐落於DNA上. 以ChIP assay觀察目標DNA片段, 可以看到大約在Rta表現6-12小時就可看到Rta結合在DNA上, 而CTCF的訊號則在較後面的時間點(24小時)變弱.–>>
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20131015 journal club paper
Dear all: Here is the paper I’ll present next Tuesday, please check and enjoy it.
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Prof Chow 周芷 visit
E2: dimerE1: di-hexamerOnce integrated, HPV is no longer reproducible. G0: basal cellsHPV DNA amplifies during G2 arrest (CCNB in the cytoplasm) p130 is the key: disappears and re-appear during keratinocyte differentiation (reactivates cell cycle, promoting S-phase); N268D U0126
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放鬆的方式有很多種
實驗室減壓方式有許多種 但是SFL覺得重點只有一個 就是要 〔放得下〕 學習放下批評者和你的看法不同處 學習放下你和惹你懊惱者的不同處 學習放下時間老是不夠用的惡習 早一點動手 承認無法接受這份工作
2013-10-01 Journal Club
大家好，這篇是蕃茄10/01要報告的paper，請查收，謝謝! (Elevation of S100A4 expression in buccal mucosal fibroblasts by arecoline–involvement in the pathogenesis of oral submucous fibrosis-PLoS One 2013) 大家好，這一篇是2號版主附贈的相關paper，請查收，謝謝!(Identification of two distinct carcinoma-associated fibroblast subtypes with differential tumor-promoting abilities in oral squamous cell carcinoma.)
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09/18 Lab Meeting
小羊畢業口試rehearsal! ——– 意見彙整:Major Comment:1. 不要對著螢幕解釋抄來的英文內容，這是論文口試、不是即席英文翻譯。試著把英文二行以上的句子縮短微小於二行、或是直接改成中文。另外要時時看一下聽眾的反應。2. 要打講稿，注意大約一分鐘一張slide。3. 覺得不好講的地方要用圖表幫忙。4. Introduction 是不是改成 口腔癌–> Gene Fusion–> FGFR3 –> TACC3 會不會比較順? (或許論文也應該這樣子編排比較好。不過別擔心，有了「Insert目錄後」，改那個很快)5. Cell Line 名稱要做個簡單的表格、在需要的地方帶出來，因為不做這個題目的不熟這些cell line, 會不知所云。Specific Comments (slide number 可能會差一、二號):Slide 1 :頭頸癌的skin若發生病變應屬皮膚癌而非HNSCC. 1982到2013才上升一位，不能叫做一路攀升。應強調男性發生率及癌症死亡率即可Slide 3 (cartoon of FGFR3 signalling pathways): 明明是五個箭頭、為什麼你卻說四個pathway?Slides 3 & 4: tyrosine kinase domain 要指對地方。Slide 8: 英文有錯，考慮用中文。Slide 10: 圖扭曲得很難看. TMPRSS2 是 protease? 那保留甚麼功能區? 圖A和C不同點在哪裡?Slide X (結果第一張) 要附 F3-T3、抗體、shRNA位點的示意圖，而不是一直對著空中指指點點。Slide
2013-09-17 Journal Club
Title: EGFR Inhibition Promotes an Aggressive Invasion Pattern Mediated by Mesenchymal-like Tumor Cells within Squamous Cell Carcinomas.(PubMed) (Accepted MS下載)
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六祖壇經精選
本系列講座中，聖嚴法師以四大主題，展現《六祖壇經》的精華內容。《壇經》不僅是惠能大師一生說法的精要紀錄，亦是最具代表性的中國禪宗寶典。透過聖嚴法師生活化與現代化的講解，我們將更能體會禪法的活潑與實用，了解到一切煩惱都源自內心的執著。只要在生活中體驗佛法、練習運用佛法，學習不被外境所動，，在自身親見佛的三身！(法鼓山普化中心) 之一：無相三皈依 (一～四 01-04)聖嚴法師說：「用心外的三寶，幫助我們發現心內的三寶，這是最可靠的」。讓我們循著「六祖壇經」的智慧法語，開發本具的自性三寶，回到生命的真正歸依處。 之二：一體三身自性佛(一～三 05-07) 聖嚴法師告訴我們，因眾生根器不一，所見的佛也不一樣。然而，佛雖有三身，實則本體為一，且無處不在。回歸自性的當下，即能成就佛的「一體三身」。 之三：三身佛 (清淨法身佛之一~三 08-10; 千百億化身佛 11; 圓滿報身佛之一~二 12-13) 聖嚴法師進一步解說，在日常生活中，只要一個轉念，煩惱消失，智慧即現前。因此，每個人都可以親證佛的三身，展現慈悲與智慧的光明。 之四：無相頌 (一～五 14-18) 聖嚴法師提醒我們，修行不只是要止惡行善，乃至一切善法都得放下。要以無所求的心，如此一來，所做的一切，就是種下出世得解脫的正因。 之五：參請機緣(一~七 19-25) 內容主要為六祖大師與其得法弟子間的對話，說明修行得力時可能會遇見的窒礙與執著，乃至如何透過正見的導歸，讓自己能真正與佛陀的智慧相應相契。