20130410 Lab Meeting-FYC

FGFR3-TACC3 gene fusion 1.將Oral cancer的gDNA及cDNA臨床sample透過PCR的方法篩選完畢。 2.測試過不同方法進行Nested PCR,期望改善PCR結果smear的現象,目前看來效果有限。 3.之後的實驗方向 : 對手上的oral cancer sample進行分析,偵測其中是否含有C9 type的gene fusion或者已在其他cancer中被報導過、不同於C9 type的F3-T3 gene fusion。

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(舉手發問) 關於array Enrich 有沒有哪套軟體 或是 database 是可以將gene name / probe / expression ratio 輸入 去觀察哪些signaling pathway change的?

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HPV in oral cancer

關於HPV in taiwan oral cancer 今年在生醫年會 有看到長庚解剖學科 鄭授德  副教授 有一張poster 是長庚所蒐集的OSCC case中 HPV P16的比率 (CISH & IHC)結果 裡面有 pathological characteristics 不同部位oral cancer 的patients HPV P16+ 的比率 在 40% ~ 60% overall 比率 也在一半左右 我記得是50出頭 但是 HPV 跟 survival rate / pathological characteristics  p value 都沒有顯著差異 Survival curve是有一比較低的狀況 因為 第一作者(鄭) 在現場拍他自己的海報 我本來以為是可以拍 但是 瞄久了 他就問 對這有興趣嗎?

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DDR1 新作

J Biol Chem. 2013 Mar 21. Shedding of discoidin domain receptor (DDR) 1 by membrane type (MT)-matrix metalloproteinases (MMPs). Fu et al.  Wayne State University, United States

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