新書發表-Pathway Book v1

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由 sufang 在 三, 06/25/2014 – 10:37 發表 Pre-published 40TN 4NQO DOK Molas Oral Cancer 親愛的大家：我心目中的pathway mapping結果終於做好了! (按我下載Pathway book v1)。這是由三項microarray 分析結果而得到的結果, including (1) 40對T/N病人檢體; (2) (娟與夏的)AC, NNK, NIC-treated DOK cells; (3) 劉柯的 4NQO/AC-mouse. (按我下載 40TN_DOK_4NQO_Combo v1)。   下面開始說故事: 40TN的array結果經由江博的11SVA校正過batch effect後，把重復probe留下hybridization signal p value較低的那一個，因此每個基因只有一筆資料。這時的data稱為unique，n=16938。從unique中再去掉所有p > 0.05的gene，剩下的data稱為unique p < 0.05，n=12420。針對這12420個基因，每個基因都有一個average T/N，是由平均40對檢體T/N而來的，以倍數(fold)表示，大於二倍以上差異的有2508。 (frozen) 江博另外以Cox regression和病人資料作分析，T的部份與 recurrence有關的基因，p < 0.05者共有1947個。(frozen) 江博另外以Cox regression和病人資料作分析，T的部份與 survival有關的基因，p < 0.05者共有1366個。(frozen) 4NQO mouse model，以Illumina

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清大生科院 Biotech Job Fair

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外來文轉發 敬邀參加 5/29/2014 清大生科院 Biotech Job Fair 各位生技產業及教育界先進您好: 清大生命科學院長期培育跨領域的優秀生物科技、生物醫學人才，包括學士、碩士、博士、及博士後研究員。 清大生命科學院生科院職涯發展中心(NTHU College of Science Career Development Center)將於五月二十九日(星期四)下午舉辦『生物科技明日之星校園徵才(2014 NTHU Biotech Job Fair)』，敬邀 貴單位提供半年內預計徵聘人才的企業界職缺資訊。 敬請於四月十四日(星期一)前提供「企業人才需求表」，我們會依據 貴單位的人才需求內容收集本院及本校相關領域人才資訊，並積極媒合雙向互動。 歡迎您於五月二十九日蒞臨本院參觀及指教。 敬祝    順心如意 國立清華大學生命科學院職涯發展中心 黎耀基、張大慈敬邀   本活動聯絡人：楊子儀小姐 E-mail：show@life.nthu.edu.tw 電話：03-5742165

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Primary NP cell from CELPROGEN

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由 ingrid 在 四, 05/22/2014 – 15:53 發表 EBV and KSHV Cell Lines EBV infection Ingrid 瑞柏代理 網頁 http://www.celprogen.com/index.php?route=product/product&filter_name=nasophary&product_id=2028&path=26_44_45_47  Celprogen原廠配合的廠商為World Courier。 原廠並無販售coating matrix,所以可能還是建議需要購買它們家的耗材。

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很玄但是非常重要的文章 CTCF

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由 sufang 在 四, 05/15/2014 – 15:44 發表 EBV and KSHV chromosome conformation capture (3C) cohesion CTCF Topologically associated domain (TAD) Cell. 2014 May 8;157(4):950-63. doi: 10.1016/j.cell.2014.03.025.   Predictive polymer modeling reveals coupled fluctuations in chromosome conformation and transcription. Giorgetti L1, Galupa R1, Nora EP2, Piolot T1, Lam F1, Dekker J3, Tiana G4, Heard E5.Author information

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好康相報

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清華大學生命科學院職涯發展中心(NTHU College of Science Career Development Center)將於五月二十九日(星期四)下午舉辦“生物科技明日之星校園徵才” (2014 NTHU Biotech Job Fair)，目前已有19家廠商提供62項職缺資訊（博士職缺約需14名、碩士職缺約需40名以上及學士職缺約需14名），請點閱〝job fair(公告)〞或活動網址http://2014JobFair.life.nthu.edu.tw，（職缺訊息不定時更新）。 歡迎各位老師轉知活動訊息給實驗室應屆畢業生，敬請於五月二十日(星期二)前提供“履歷表“(點選下載)，E-mail寄給活動聯人–楊子儀小姐收show@life.nthu.edu.tw，我們會依據各位的意向資料提供給廠商進行媒合作業。 國立清華大學生命科學院職涯發展中心 黎耀基、張大慈、焦傳金 敬邀

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DOK_MOLAS analysis related

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由 sufang 在 三, 05/07/2014 – 16:40 發表 Oral Cancer DOK Molas Oral Cancer 提醒: MOLAS入口: 40T/N: 請用「Library comparison」, compare “average” and “N”. 4NQO mouse: 可按「Cludtering」–> view clustering result 玩玩看。 DOK project. login: pwd: 05/07 SFL小notes: ASS1 in NNK and AC treatment 都有下降。 Shiah’s AC vs DOK3: “GO: microtubule binding” ranks the best p-score. 共有17個genes invovled

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