由 sufang 在 二, 07/29/2014 – 23:14 發表 Pre-published Field Effect NOTCH Oral Cancer 重要文獻: Leemans CR, Braakhuis BJ, Brakenhoff RH (2011) The molecular biology of head and neck cancer. Nat Rev Cancer 11: 9-22. (pdf 2833) Hu B, Castillo E, Harewood L, Ostano P, Reymond A, et al. (2012) Multifocal Epithelial Tumors and Field […]
FGFR2 Gene Fusion文獻快速入門: 1 Wu, Y. M., F. Su, S. Kalyana-Sundaram, N. Khazanov, B. Ateeq, X. Cao, R. J. Lonigro, P. Vats, R. Wang, S. F. Lin, A. J. Cheng, L. P. Kunju, J. Siddiqui, S. A. Tomlins, P. Wyngaard, S. Sadis, S. Roychowdhury, M. H. Hussain, F. Y. Feng, M. M. Zalupski, M. Talpaz,
重要文獻列表_Cholangiocarcinoma Read More »
由 sufang 在 五, 07/25/2014 – 10:50 發表 Pre-published CCA TLCN申請書 檢體 Letter_of_Intent_FGFR fusion (to be FTPd) Biosamples_Request_Form_gene fusion (to be FTPd) 相關書信 a recent published genomic changes in IHCC 12 messagesLTCHEN Sun, Mar 23, 2014 at 9:55 AM To: hung1228 , “Kelvin Tsai K.” , Chien-Feng Li , Su-Fang Lin , 姜乃榕 , Chiun
NHRI TLCN CCA 檢體申請書 Read More »
由 natsumi 在 四, 07/17/2014 – 17:30 發表 EBV and KSHV Methylation 最近聽Dr. Lin講Methylation的故事，我想到之前曾經做過的一個小實驗，分享之。 AB851 #1由 ingrid 在 五, 07/18/2014 – 12:20 發表。 ER沒有被acetylated-lysine Ab認到 #2由 ingrid 在 五, 07/18/2014 – 15:30 發表。 其他Data #3由 sufang 在 五, 07/18/2014 – 14:48 發表。 是KR! 記錯了，所以ER什麼都沒有! 可能只有phosphorylation. -而且只有 Ser/Thr-phosphorylation. #4由 sufang 在 五, 07/18/2014 – 09:10 發表。
5年前的一個小實驗 (EBV and KSHV Methylation) Read More »
Paper:http://genomebiology.com/content/pdf/gb-2006-7-10-r100.pdf 軟體下載網頁:http://www.cellprofiler.org/ 這也是BROAD Institute 出的一個軟體 應該可以取代AIS 來計算invasion 細胞數目 甚至可以提供更多功能 只是 目前我自己沒有要用到的地方 就沒有鑽研了!
由 sufang 在 六, 07/05/2014 – 17:12 發表 Pre-published Arecoline COE (Cancer of Excellence) OPMD Potentially malignant disorder 10/05/2014 (SUN) PK大賽 第二期癌症研究缺口補強計畫評選會議議程 開會時間：103年10月5日（星期日）上午10時 開會地點：本部204會議室 壹、主席致詞 貳、報告 時間 報告事項 報告單位及時間 10:05-10:20 一、科技發展組會議說明 二、簡報及委員問與答(報告10分鐘、問與答5分鐘) 10:20-10:35 (一)三陰性乳癌缺口補強研究計畫: 聚焦生物特性，個人化治療及新治療策略 (1100萬) 國立台灣大學醫學院附設醫院 10:35-10:50 (二)以基因體學方法找尋台灣早發性乳癌相關基因及生物標記 國家衛生研究院 10:50-11:05 (三)大腸直腸癌早期篩檢高準確率之生物指標開發 臺北醫學大學 11:05-11:20 (四)合併使用血清生物標計與糞便潛血反應於大腸直腸癌的篩檢效益(280萬) 國立台灣大學醫學院附設醫院 11:20-11:35 (五)大腸直腸癌免疫基因體檢測與人源化腫瘤(PDX)動物模式之開發(600萬) 國家衛生研究院 11:35-11:50 (六)吲哚胺-2,3-雙加氧酶在大腸直腸癌腫瘤進展與臨床預後之分子剖析:
由 sufang 在 六, 06/28/2014 – 15:59 發表 Oral Cancer 4NQO Oral Cancer 說在前頭: 目前我拿的還是Illumina normalized的”group” data. 這和江博前次所提，做過SVA1的M0, M1, M2, M3稍稍不同。等江博轉好他的data給我，我會儘快送入Molas，到時就可reconfirm大家心目中有興趣的基因/pathway在兩組資料中有 沒有差很大。 所以，我再囉唆一次，因為看了下面兩個圖後，我把stage 2的資料先不加入分析，因此僅看 stage 0, stage1, stage 3, stage 4的基因變化趨勢，共篩出543個基因，也就是Pathway Book v1中的”mouse model”部份。 開始敘述分析結果: DDR1在這個可愛的老鼠model中，表現量也是和staging有關: 1171 -> 1256 -> 1730 ->1829 算它1.5x上升，40T/N中是1.61x! 哈哈哈 哈哈哈哈…… ENO1: 1680 -> 2294 -> 2321 -> 3443.2, 平均1.7x。(工商服務: 四月初胰臟組同仁認為ENO1是CSC marker之一 日前po文按我)
劉柯的4NQO老鼠與40T/N交叉比對部分 Read More »
由 sufang 在 六, 06/28/2014 – 16:03 發表 Oral Cancer DOK NIC nicotine Oral Cancer Nicotine (NIC) – treated DOK: 針對NIC4, NIC5, NIC6 vs DOK1的array data, 配合日前所提, NIC-treated DOK clones 有明顯增加cell proliferation及migration的現象, 可能參與的pathway/genes有: DNA replication: MCM10 (3.37x), RECQL4 (2.32x), GINS2 (2.32x), CDC25A (3.01x), CDC7 (2.227x), NASP (2.19x), DTL (2.38x)。 Cell cycle: E2F2 (2.22x), CDC6 (2.75x), CDC7(2.27x),
Hi 大家好，我是思恒:很高興加入這個社團! 癌症研究的路，我才剛起步，還有許多事要和大家學習。如果有機會做出有用的研究，對人群健康有貢獻。即使一點點也好，我就可以滿意於自己決定做研究的人生選擇與職涯。 抱著這樣的想法，我來到這裏，和大家一起努力。 請多多指教!謝謝!