由 ingrid 在 二, 04/01/2014 – 13:03 發表 Cholangiocarcinoma FGFR fusion 高醫 黃道揚 Dear SF, My mailing address is:高雄市三民區自由一路100號5F腎功能室. ———————– SFL1=988 ng/ul C9 RNA 15 ug = 15ul (希望他能訂出FGFR3-TACC3) SFL2=792 ng/ul SW780 RNA 15 ug = 20ul (希望他能訂出FGFR3-BAIAP2L1) SFL3=1100 ng/ul TW2.6 RNA 15 ug = 13ul(希望他訂不出任何FGFR3 fusion) #1由 sufang 在 五, 07/25/2014 – 11:29 發表。 7/24 黃醫師來函 Daw-yang Hwang […]
由 sufang 在 四, 03/27/2014 – 00:00 發表 Oral Cancer Arecoline DOK nicotine NNK OrCa小組會議 (03/27/2014) 素芳的筆記本： nicotine: 500 uM NNK: 10 uM arecoline (AC): 50 uM or 100 uM treated for ~ 1 year, looking for carcinoge-tolerant cell clones, eg. NNK4, NNK5, NNK6, NIC4, NIC5, NIC6 doubling time migration assay In vivo tumorigenesis Expression
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LabMeeting-小丸由 EVKVLIN 在 二, 03/25/2014 – 00:00 發表 LIN Lab 2016 LabMeeting maruko 小丸2008/09/09 Lab Meeting 心得彙整 Maruko:要不要考慮這個跟這個,還有一個這個. 另外S186A是一個至今仍然未解的有趣mutant. 它可以bind DNA,可以transactivate一些promoter,有被訂出in vivo是被PKC磷酸化,但似乎此位點磷酸化的有無與disrupt latency無關.所以此例子並不適合追太久.. 2008/09/16 Lab Meeting 心得彙整 Maruko: (1) 為確保293TetKR中仍是每個細胞均具有transgene,小丸子成功地以flow demonstrated that, although weak, but Dox treated 293TetKR homogeneously shifted the anti-flag staining (1:50) to the right (not seen in 1:100 staining). 這樣子的結果可以讓我們安心的繼續使用這個細胞株.當初其實很怕是部份細還有KR,部份細胞則沒了,而以immunoblotting 又分不出來,所以小丸子勇猛地做這個實驗(熱烈鼓掌 霹靂啪啦 霹靂啪啦)智者常言:打鐵趁熱,所以讓我們也篩一下ER.能否請小蓮協助/學習小丸子把手中的293TetLuc及TetER也做一次這樣的實驗,我猜KR不幸是最弱的表現者.
LabMeeting-Ingrid由 EVKVLIN 在 三, 02/12/2014 – 00:00 發表 LIN Lab 2016 Ingrid LabMeeting YCK LabMeeting-Ingrid 由 EVKVLIN 在 三, 02/12/2014 – 00:00 發表 LIN Lab 2016 Ingrid LabMeeting YCK 2008/09/09 Lab Meeting 心得彙整 Ingrid: (1) Preparation of GST-KR for polyclonal antibodies: protocol okay, 但把benzonase加入resuspending buffer中,而protease inhibitor放在第一次thaw完的lysate中,如果還是很黏的話要在thaw完後sonicate 15~30秒 (2) 366/367EE 有抑制現象!請再repeat一次,並且加入pFA-系列,如果也是抑制：(A) 以IP確認WT,366AA及366EE和HDAC1之interaction(we’ve bought this ab, didn’t
20140212 Lab meeting – ingrid Read More »
小羊畢業口試rehearsal! ——– 意見彙整:Major Comment:1. 不要對著螢幕解釋抄來的英文內容，這是論文口試、不是即席英文翻譯。試著把英文二行以上的句子縮短微小於二行、或是直接改成中文。另外要時時看一下聽眾的反應。2. 要打講稿，注意大約一分鐘一張slide。3. 覺得不好講的地方要用圖表幫忙。4. Introduction 是不是改成 口腔癌–> Gene Fusion–> FGFR3 –> TACC3 會不會比較順? (或許論文也應該這樣子編排比較好。不過別擔心，有了「Insert目錄後」，改那個很快)5. Cell Line 名稱要做個簡單的表格、在需要的地方帶出來，因為不做這個題目的不熟這些cell line, 會不知所云。Specific Comments (slide number 可能會差一、二號):Slide 1 :頭頸癌的skin若發生病變應屬皮膚癌而非HNSCC. 1982到2013才上升一位，不能叫做一路攀升。應強調男性發生率及癌症死亡率即可Slide 3 (cartoon of FGFR3 signalling pathways): 明明是五個箭頭、為什麼你卻說四個pathway?Slides 3 & 4: tyrosine kinase domain 要指對地方。Slide 8: 英文有錯，考慮用中文。Slide 10: 圖扭曲得很難看. TMPRSS2 是 protease? 那保留甚麼功能區? 圖A和C不同點在哪裡?Slide X (結果第一張) 要附 F3-T3、抗體、shRNA位點的示意圖，而不是一直對著空中指指點點。Slide
1. Cyberduck (ftp://sflin@nas.nhri.org.tw/PROJECT/sflin, port 21)2. KegArray 3. WebGelstat (beautiful GO Tree) 4. GSEA
一個Fortune Teller應該有的配備… Read More »
LabMeeting-小嬿由 EVKVLIN 在 二, 03/12/2013 – 00:00 發表 LIN Lab 2016 LabMeeting mmiiee 小嬿 2008/08/27 小女子深受luciferase assay的internal control困擾所以上網找其他人有沒有這類的東西看到了一個網址http://www.protocol-online.org/biology-forums/posts/11321.html可是這個人的問題是他的internal control會降低跟我的不太一樣後面有個人(doles)有建議 可以試試看phRL vector是個合成的RL, 據說比較不會受到non specific的activator 影響而且我剛剛又去看了一下珮雯學姊的論文他用的就是Promega的phRL-TK是因為這個原因所以他做起來才不會受影響嗎?請老闆大人提示~~~~謝謝 2008/08/29 送MGM定序SOP DNA 0.5-0.6 ug Primer 4 ul of 2 uM H2O to 8 ul 第一次做不出來若想不到明顯錯誤處可再送一次 2008/09/09 Lab Meeting 心得彙整 小嬿: 講得很清楚喔!知道已給妳太多paper了讀不完(sorry) 但是,可否,拜託,先讀一下這四頁知識,幫我們summarize 一下. 我覺得瞭解這篇以後,對往後妳和小丸子的實驗設計非常有用(才不會走錯路)因為這實在是太顛覆我過去的想法了! 2008/09/23 Lab Meeting 心得彙整小嬿: (1)BC- 1及P3HR1的fuctional assay真的很有趣. 看來gZ及cZ都有function.tZ大概真的是一個Z的suppressor.
Pyrosequencing machine 現在正在我們實驗室，廠商預計會放一個月，Allen會來用，我想應該還會有空檔，有需要的同仁(SFL and YWC lab)，也歡迎你們來用(千萬不要宣揚!)
Pyro-sequencer is on my lab now! Read More »
全文在這裡。把Copywriter改成paper writing, paper reading等等你每天要做的事情皆合適。Four points:1.Get More Sleep (7–8 hr/Day)2.Reduce Distractions (讓我想到在學校裡，一堂課40~50分鐘不讓你做雜事是有道理的)3.Eat the Frog (存疑)4.Set Mini-Deadlines (學習規劃最重要，避免眼高手低是可以訓練出來的)要提高工作效率，SFL認為睡飽飽很重要，DAVID則覺得吃飽飽也很重要，因此第3點建議很好，青蛙用來煮湯或三杯都很棒，這個作者不錯，知道青蛙可以用來補精力! 🙂 (素食者不宜) ps: “eat thr frog” 是指將比較困難或複雜的工作排在一天的開始，優先執行，如果完成了，不僅成就感大，其他較簡單的工作任務，就更容易完成了，因為最困難的不是完成了嗎? ~~共勉之 (謝謝DAVID桑的翻譯與重點提示!)
4/10 SFL wrote:Sorry FYC, 多兩篇給你! (ref new 1), (ref new 2)。另外, 下面的ref 3–7你可以先忽略不必看。—————————- 恭喜小丸子、Ingrid得獎!!也謝謝小夏、小嬿的努力，我們和knicks一樣→work as a team，個人獲獎就是整個team的榮耀! 所以請客這種事就是老闆出錢、夥計們出力就對了! 往下大家(包括FYC)的目標調整如下: 1. 要present的圖，包括平日lab meeting均要run一下統計。 2. EBV related: (a) Infection of NP460hTert with Akata-GFP EBV (ref 1, ref 2) (b) Rta-mediated genome organization (ref 3, ref 4, ref 5, ref 6, ref 7)。3. Oral cancer related : (a)