由 sufang 在 五, 07/25/2014 – 10:50 發表 Pre-published CCA TLCN申請書 檢體 Letter_of_Intent_FGFR fusion (to be FTPd) Biosamples_Request_Form_gene fusion (to be FTPd) 相關書信 a recent published genomic changes in IHCC 12 messagesLTCHEN Sun, Mar 23, 2014 at 9:55 AM To: hung1228 , “Kelvin Tsai K.” , Chien-Feng Li , Su-Fang Lin , 姜乃榕 , Chiun […]
NHRI TLCN CCA 檢體申請書 Read More »
由 sufang 在 六, 07/05/2014 – 17:12 發表 Pre-published Arecoline COE (Cancer of Excellence) OPMD Potentially malignant disorder 10/05/2014 (SUN) PK大賽 第二期癌症研究缺口補強計畫評選會議議程 開會時間：103年10月5日（星期日）上午10時 開會地點：本部204會議室 壹、主席致詞 貳、報告 時間 報告事項 報告單位及時間 10:05-10:20 一、科技發展組會議說明 二、簡報及委員問與答(報告10分鐘、問與答5分鐘) 10:20-10:35 (一)三陰性乳癌缺口補強研究計畫: 聚焦生物特性，個人化治療及新治療策略 (1100萬) 國立台灣大學醫學院附設醫院 10:35-10:50 (二)以基因體學方法找尋台灣早發性乳癌相關基因及生物標記 國家衛生研究院 10:50-11:05 (三)大腸直腸癌早期篩檢高準確率之生物指標開發 臺北醫學大學 11:05-11:20 (四)合併使用血清生物標計與糞便潛血反應於大腸直腸癌的篩檢效益(280萬) 國立台灣大學醫學院附設醫院 11:20-11:35 (五)大腸直腸癌免疫基因體檢測與人源化腫瘤(PDX)動物模式之開發(600萬) 國家衛生研究院 11:35-11:50 (六)吲哚胺-2,3-雙加氧酶在大腸直腸癌腫瘤進展與臨床預後之分子剖析:
由 sufang 在 三, 05/07/2014 – 16:40 發表 Oral Cancer DOK Molas Oral Cancer 提醒: MOLAS入口: 40T/N: 請用「Library comparison」, compare “average” and “N”. 4NQO mouse: 可按「Cludtering」–> view clustering result 玩玩看。 DOK project. login: pwd: 05/07 SFL小notes: ASS1 in NNK and AC treatment 都有下降。 Shiah’s AC vs DOK3: “GO: microtubule binding” ranks the best p-score. 共有17個genes invovled
DOK_MOLAS analysis related Read More »
重要文獻集中區_Oral Cancer 由 sufang 在 二, 09/16/2014 – 14:01 發表 Oral Cancer Knowledgebase Literatures Oral Cacner Recent update on 2015/05/12。 Start: 04/09/2014 Timezone: Asia/Taipei 發送此內容 Transfer this content to remote ELN server Bookmark/Search this post with ‹ HPV and p16 in HNSCCOSCC Cell Line STR information 20150312 更新版 › 增加新的回應 行事曆
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LTCHEN Apr 7 (2 days ago) Reply to Kelvin, hung1228, 施能耀 Shih), 劉柯俊 Liu), 顏伶汝, 林素芳, PonDear ALL:We need such close collaboration for the exchange of idea, resource and material in order to speed up data and paper/patent generations! Thanks!LT ChenPS: SF, Have your FGFR2 mRNA ready? 在 2014/4/7 下午10:22 時， Kelvin K. Tsai
所長來函: Increased ENO1 positive cells in pancreatic cancer CSCs Read More »
LabMeeting-小夏由 EVKVLIN 在 一, 04/07/2014 – 10:30 發表 LIN Lab 2016 LabMeeting natsumi 小夏 2008/09/16 Lab Meeting 心得彙整小蓮:sip21/sip27 其實都蠻成功的.請再repeat一次這組實驗(去掉gapdh後共六個sample,seeding sample時細胞數目要算對,記住搖勻(前後左右,而非順/逆轉, wagada?)si轉染部份照舊,五個要加Dox,Dox加後6~9天內做綠染) Pusa bless you. 2008/09/23 Lab Meeting 心得彙整小蓮:微調ERKV/rapa調件,重複HONE1/ER transient transfection (除了western外, wst-1會重做嗎?),還有,我們算講完了嗎? 2008/10/14 Lab Meeting 心得彙整 小蓮: Rapamycin對ERKV似乎有正向作用,黃老師建議思考mTOR可能是宿主細胞反制病毒活化的機制之一, 現在block住它,virus活化得較高興.這是很有意思的論點,要記住. siRNA繼續調條件中,HONE1補作ER實驗似乎okay. Slide做得很好(可是最後一張圖下方忘了加lane number,加上去就可與左邊說明相乎應). Good. 2008/10/21 Lab Meeting 心得彙整 小蓮:HONE-1 transient transfection的rH2AX及actin待補齊,也期待paper被review得順利☺。 mTOR pathway對ERKV reactivation似乎是抑制作用而非加成。建議再跑一、二片新膠確定p70S6K有被抑制、KR/p21/p27/ER有沒有出來(用NTU的抗 體,因為1ng/ml的Dox24h可提引出的Rta可能不多。原來那片blot,請留給下週BioRad新機demo時用flag染,配套他們的超強 ECL試劑和儀器,看做得出來嗎)。 si-p21/p27部份保持這一次INTERFERin三天,然後dox三天的步驟(L2K同樣條件下似乎toxicity較強一些)。另一盤 duplicate留做老化綠染用(Good)。Hoeffer
2008/09/03 Lab Meeting心得彙整 1.一週三天有固定時間不能做實驗,會不會太沒效率了?來和與星期二下午的大瞇合辦怎麼樣? 就是說當天不在大瞇報的二個人就在小瞇報. 小瞇就排在大瞇前一小時,也就是一點或一點半和SFL討論.這樣一來平均每種meeting(被瞇得昏昏欲睡了吧)就是二個星期報一次. SFL昨天確實有被擊垮的感覺 （還是太久沒好好靜坐了?）2. RAZ 最早是小Kenney和飄魄的Pagano發現的.這個實驗室和英俊的Sergeant有進一步探討 3. Transcriptional activation 與 轉錄因子phosphorylation 正相關之例子搜尋4. 低溫長時或高溫短時對GST-N600/GST-Q658之水溶性影響, KR OGlcNAc 最後一張圖待補5. CKI與老化 (ERKV與PI3Ki/CKI) 6. Failure in 293/green EBV (DNA from ingrid or CGU) 2008/09/16 Lab Meeting 心得彙整 CCL:亞硝胺stock分裝成小包裝,每次拿一瓶aliquot出來用,用完即扔不重複使用. 請再做一次Dox (5 ng/ml) alone,24~72小時的提引(若細胞夠再加入亞硝胺部份(0.05 ug/ml)的實驗組). 預期的EAD expression kinetics 請參照白板上心瑋/小嬿之powerpoint列印檔.謝謝. 2008/12/02 Lab Meeting 心得彙整 Team-work部份結果已出爐, 正商請李老師幫忙分析中。綜合目前western結果,小丸子的二批檢體都有 wash-off現象,小蓮的檢體正以EV、KV downstream protein來確定標示問題。等確立完成後再來萃取RNA。Ingrid的兩批則較沒有wash-off現象,原因不明。另一批要抽RNA的檢體是沒有 dox的control。小結:Team-work–>Perfect!看來我們會得到一張相當不錯的地圖的。很振奮耶,米那桑。 2008/12/16
#1由 ingrid 在 三, 01/14/2015 – 16:52 發表。 RT-qPCR protocol #2由 ingrid 在 一, 01/05/2015 – 16:57 發表。 用GAPDH當internal control #3由 ingrid 在 一, 12/22/2014 – 16:18 發表。 arecoline-oral keratinocytes RT-qPCR相關的結果 送去做RNA-seq的OKB2細胞的RNA，做了3次RT-qPCR，但結果似乎都不如預期，只選擇一次結果放上去。 #4由 sufang 在 六, 01/10/2015 – 20:32 發表。 Nature. 2015 Jan Nature. 2015 Jan 8;517(7533):170-3. doi: 10.1038/nature14029. Glutathione activates virulence gene expression of an intracellular
由 mmiiee 在 四, 04/03/2014 – 11:43 發表 LIN Lab 2016 LabLog mmiiee 小嬿 LogID Title Initial Date AC001 To test EBV DNA polymerase primer by Q-PCR (trial 2) YJC 3/21/10 AC003 Test induction efficiency of TW01-EREVp2089 clones by SB (trial 2) YJC 3/22/10 AC004 To detect EBV Rta level between EREV8 and NA cells