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慈濟上課講稿

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2021/05/20 慈濟生科系 各位同學大家好在今天演上課前，我先複習一下去年在這邊講的東西. 去年我們主要講的是口腔癌及癌前病變腫瘤微環境 英文是tumor microenvironment. 這是腫瘤微環境的一個卡通圖，我們長時間以來對於腫瘤細胞部份(Point to purple part)做相當多的研究，好比找到許多的oncogene or tumor suppressor gene等等. 然而，多數癌症仍然無法根治。於是有人就開始注意到除了腫瘤部分，其周遭微環境其實還有許多成分，利如免疫細胞(),成纖維細胞(),內皮細胞()以及鋪在細胞下或細胞間的 extracellular matrix (ECM),這些成分漸漸引起大家的注意，並且越來越多的證據顯示他們是共犯且在腫瘤進化過程中扮演不可或缺的角色。（next slide) 舉例來說這是著名的癌症免疫循環，一共分為七個步驟順時鐘，分別是免疫系統中的的樹突狀細胞，dendritic cells抓取並且把癌細胞的識別部份表現給T cell，進而活化湯於是產生很多的毒殺型 T細胞並且進入癌細胞部位，將其消滅或是抑制其生長，而完成一個癌症免疫循環。重要的是，每一個步驟都有 stimulators or inhibitors，當微環境中抑制的成分較多時，腫瘤細胞就會長得快、比較惡性，也因此目前的癌症免疫療法針對的就是如何把這些抑制劑抑制起來，也就是我們數學裡頭說的負負得正，讓腫瘤微環境中癱瘓掉的免疫細胞能夠活化回來。next slide 上次也介紹過一個非常好用的生物資訊程式叫做CIBERSORT。這個線上程式可以幫忙估算一個檢體中，22種免疫細胞的組成成分。舉例而言下面是台灣成大醫院提供的40個腫瘤以及腫瘤鄰近正常細胞的microarray dataset. 這個箭頭的左方是40個鄰近正常的檢體，這個箭頭的右方是40個腫瘤檢體。一眼看過去大家可以看得到最多的是這個淺綠色的細胞（CD4 memory T）以及這個橘子色的細胞（activated dendritic cells） (next slide)進一步以limma針對這22種細胞在40T及40N推算結果做比較，可以清楚看到剛才提到的CD4 memory T及activated dendritic cells，都具有極高可信度。 (next slide) 另一個新技術是單細胞定序(single cell RNA or transcriptomic sequencing) 這裡舉例說明口腔癌的一個單細胞定序報告，這是集合18例美國口腔癌病人檢體的實驗   一共定序5千九百零二顆細胞，根據每種細胞表現marker gene 及腫瘤細胞chromosome 具有copy number

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30個馬克吐溫經典英文語錄名言 (超對)

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 (From google Groups/sflinlab2020) 2016.11.09 15:05經典語錄網 英文佳句語錄連結 馬克·吐溫，是美國的幽默大師、小說家、作家，也是著名演說家，威廉·福克納稱讚馬克·吐溫為“第一位真正的美國作家，我們都是繼承他而來”。馬克吐溫以高超的幽默、機智與名氣，被稱為美國最知名人士之一，曾被推崇為“美國文壇鉅子”。 1、It is better to keep your mouth closed and let people think you are a fool than to open it and remove all doubt.最好閉上嘴，讓別人認為你傻，而決不把嘴巴張開去解答所有的疑難。 2、Don’t go around saying the world owes you a living. The world owes you nothing. It was here first.別到處說世界虧欠了你。世界什麼都不欠你的，你還沒出生它就在這兒了。 3、To succeed in life, you

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英試推抽血驗50種癌 全國癌症死亡人數預計大降2成

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 (From google Groups/sflinlab2020) 2020/11/28 13:11 (LibertyTimes) 〔即時新聞／綜合報導〕癌症年年在十大死因霸榜，讓現代人聞之色變，不過隨著醫療進步，癌症不再被視為絕症，能否及早發現便成了保命關鍵。英國國民保健署（NHS）將與加州癌篩新創企業GRAIL合作，首度實施僅靠單次驗血便可檢測50多種癌症的癌篩措施，預計將可大幅減少2成罹癌死亡人數。 根據《CNN》報導，美國加州醫療保健公司Grail近日宣布，英國國民保健署將利用該公司的Galleri血液測試技術，對16萬5000位英國民眾實施癌症檢測，受測者僅需進行單次抽血檢驗，便可針對50多種癌症進行早期篩檢，偽陽性率均低於1％。 英國國民保健署在27日發布的聲明中，以「全球首次」來形容本次癌症篩檢計畫，據稱，本次計畫將分成2階段進行，第1階段將針對13萬5000名年紀介於50至79歲無癌症跡象的民眾實施，第2階段將納入2萬5000名具有疑似癌症跡象的民眾。 英國國民保健署指出，在英國，每天有超過1000人被診斷罹癌，其中大約有一半是在第1、2期被診斷出來的，但該機構的目標是在2028年前，將早期篩出的比例增加至75％。 英國國民保健署希望血液癌篩能鎖定目前較難早期診斷及治療的癌症，「若能在早期篩出，對於像是胰腺癌及卵巢癌這類癌症特別有幫助，可以挽救許多性命」，據稱，若將Galleri血液測試技術加入該國常規護理標準，將可讓中晚期才被診斷出來的病患數量減少將近一半，並連帶導致英國癌症死亡人數大幅下降約20％

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罹患口腔癌壽命少20年 台灣國健署：口內出現五徵兆應盡速就醫

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 (From google Groups/sflinlab2020) (台灣英文新聞/生活組 綜合報導)根據衛服部死因統計和國健署癌症登記資料，台灣每天有9名死於口腔癌，21人罹患口腔癌，尤其好發於中壯年族群，罹癌後平均壽命還整整少了一般人20年。國健署王英偉署長提醒，為預防口腔癌的發生，除拒絕使用檳榔、菸品外，還要定期口腔黏膜檢查，及注意口腔黏膜變化，可有效降低口腔癌發生及死亡風險，亦可以避免後續多重癌症之發生。 根據國健署所進行的國民健康訪問調查顯示，有嚼檳榔者7成有吸菸習慣，6成6長時間有喝酒，檳榔、菸、酒等習慣皆有者近5成。過去研究指出嚼檳榔造成口腔癌的機率為未嚼者的28倍。 嚼檳榔不僅會增加口腔癌發生機率，也會對上呼吸消化道(口腔、咽、喉、食道)造成傷害，近年研究指出嚼檳榔者罹患上呼吸消化道癌症風險，較不嚼檳榔者之風險高5倍，若檳榔、菸、酒三者皆有使用習慣，較無使用者罹患上呼吸消化道之風險更高達10.5倍! 國健署提醒「拒絕檳榔、定期檢查、及早就醫」才是預防口腔癌不二法門。早期發現口腔病灶是提升存活率與降低治療難度的關鍵，民眾若發現口內出現「破斑硬突腫」之一的情形，應盡速就醫： 破：口腔黏膜破皮超過兩週未癒合 斑：口腔黏膜出現不明的紅斑、白斑 硬：口腔黏膜逐漸變硬、緊，最終嘴巴張不開 突：口腔黏膜表面不規則突起(乳突狀或疣狀突起) 腫：臉或頸部出現腫塊或兩側不對稱 口腔癌是最容易預防的癌症！國民健康署呼籲國人要拒絕檳菸酒，定期篩檢、及早戒除。口腔黏膜檢查的目的，是要找出癌前病變，加以治療阻斷癌症發生的機會，提醒30歲以上有菸檳行為的民眾，每2年攜帶健保卡至健保特約牙科、耳鼻喉科醫療院所接受口腔黏膜檢查，若自己發現有「破、斑、硬、突、腫」其中一項症狀，要盡速就醫接受治療，就可預防口腔癌!

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唐獎第4屆大師論壇 21日起8得主輪番上陣

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 (From google Groups/sflinlab2020) 唐獎第4屆大師論壇 21日起8得主輪番上陣 22日上午9時的生醫場，今年獎項頒給3名發現免疫疾病關鍵細胞激素（IL-1、TNF、IL-6）的科學家，包括 美國科羅拉多大學總校教授查爾斯．迪納雷羅（Charles Dinarello）、 英國牛津大學教授馬克．費爾德曼（Marc Feldmann）、 日本大阪大學前校長岸本忠三（Tadamitsu Kishimoto） 。 他們將共同發表演講，主題為「修復過度活化的免疫系統，從自體免疫疾病談到細胞激素風暴」。

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三故事訴理念 台大醫新院長吳明賢盼創新知育才

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https://www.cna.com.tw/news/ahel/202007310332.aspx 3故事訴理念 台大醫新院長吳明賢盼創新知育才 （中央社記者陳偉婷台北31日電）台大醫院新院長吳明賢8月1日上任，他今天舉3個小故事，凸顯台大醫院生命無價、視病猶親的醫療服務，並積極培育人才、加強學校產業合作，發展智慧醫療、精準健康和尖端醫療3大目標。 台大醫院院長由消化醫學權威吳明賢接任、癌醫院長則是癌症醫學權威楊志新。 接任台大醫院院長的消化醫學權威吳明賢在其臉書貼出上任感言。他分享3個小故事，以闡明個人的理念。 第一個故事是二次世界大戰時，美國發現他們飛行員逃生的降落傘不時有瑕疵，有不少人因此無辜喪命。在一次會議中有人建議改變驗收的方式為「請每次得標的廠商負責人試用自己製造的降落傘」從此以後就再也沒人因降落傘打不開而命喪黃泉。 吳明賢說，服務業有句名言：「穿顧客的鞋子」。醫療不是單純的服務業，它關係病人健康與生命權益，「生命無價，視病猶親」，不是口號一句標語，而應是所有從事醫療人員的核心價值。尤其是作為台灣醫界領頭羊，台大更應以服務「急、重、難、罕」的患者為己任，用心付出。 第二個故事是英國在他們的人民到澳洲移民時，發現遠渡重洋中有不少人死於船上，後來有人改變運費計算的方式「從英國出發的人數付費改為到澳洲下船的人數付費」，自此以後存活率即大為提高，因此目標的訂定非常要緊。 吳明賢說，台大醫院目標是世界一流的大學醫院，要提供優質的標準醫療服務，還要能創造新知，培育人才。必須加強和學校的合作，也要和產業及學研單位（中研院、工研院、國衛院等）有更緊密的合作，在智慧醫療，再加上精準健康和尖端醫療（包括細胞治療，新診斷和新治療的臨床試驗），將是今後三大目標。 第三個故事是美蘇冷戰爭霸太空時，有一年美國甘乃迪總統到太空總署（NASA）參訪，上完洗手間後剛好碰到一位黑人清潔工，他於是趨前握手感謝她把廁所打掃得如此乾淨，想不到清潔工卻回答說：「不，總統先生，我不是來NASA掃廁所，我是來幫大家登陸月球的」。 吳明賢說，若要成事，若要達成任務，必須要有同心的團隊及共同的願景。他作為台大隊的總教練，將凝聚教練團所有成員的向心力，做好聯結內外，爭取更多資源，提供機會讓球員充分發揮。

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Good Talks – Mina Bissell, Eric Sahai, Howard Chang

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 (From google Groups/sflinlab2020) Mina Bissell (LBNL, UC Berkeley):  Half the secret of the cell is outside of the cell (https://youtu.be/hBBOMTIXlL0) 記得開字幕 (雖然她的英文已經很標準) _____________________________________________ Eric Sahai 目前只找到 interviews… 2014/02/06 JCF meets cancer researcher Dr Erik Sahai (https://youtu.be/FXLLImUQdOs) 2014/03/21 Dr. Erik Sahai – at CANCERCON 2014 (https://youtu.be/_KvJyeDF3w0) (原來他有印度血統!) 2015/11/11 Tumour: stroma interactions (https://youtu.be/Avhon8jrSeQ) 2016/03/04 CF thank you – Dr Erik

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聽完昨天lab meeting後、給奕宏的建議

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 (From google Groups/sflinlab2020) 覺得YH昨天的lab meeting slide整理進步許多，值得嘉許，請繼續保持、再精進~ 雖然還有DAVID/KEGG部分沒有報完，我想請奕宏以NCKU-OrCA-40TN (n=80) 這一組data，替代TCGA HNSC (n=526) 作類似分析，建議步驟如下 請至 ExpLog_2020_04 YHL區，取一個實驗代號，題目為Molecular subtyping of NCKU-OrCA-40TN by DeClust method NCKU-OrCA-40TN expression matrix 及 metadata 請由NHRI_NICR_R2-1211/2019_12_Xena…下載 expression matrix = exprs.0419.18047.txt metadata = clinical_features_20200610.txt 另有一筆R markdown file, 是我讀開這兩個txt檔的筆記供參。 請照昨天的作法，先run DeClut，看看這80個檢體可跑出幾個subtype 跑Estimate，了解每個檢體 stromal, immune, estimated tumor 分數。 跑CIBERSORTx. 這一次用Puram (就是昨天你show的head and neck scRNA-seq) ps 蔡博士講那一篇paper的三份slide雲端連結按我。 下週二因為TY要rehearsal JC paper, 所以再下ㄧ週 (07/07)，由你來報這邊的進度:-)

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