親愛的工作夥伴們: 你累了嗎? 你煩了嗎? 你工作低潮嗎? 為了感謝大家的努力及對實驗的付出，我們將於5/18(五) 中午11:30分於R2-1042舉行一個簡單的 party，希望大家能 “暫時” 放下手邊的工作，我們就吃吃喝喝東聊西聊放鬆 “一下”，雖不是滿漢大餐，但希望夥伴們能盡情享受，這次不用你們 “跑腿”啦，就讓大夏我幫各位服務，將餐點準備好，你們——————只要自備餐具蒞臨現場就行啦!! ps:若有任何意見，請撥打客服專線31707，將由專人(就是大夏我啦)為您服務! 請勿申訴!!
Party Time is coming soon…….. Read More »
05/12/2012註冊 CCLE cancer cell line encyclopedia:nas 那一對 (這和IGV是通用的)——————–6/23/2011 Gene Pattern is the Broad Institute’s online RNA-seq suite. Can be used online (not registered yet). BWA is a fast, light-weighted alignment tool. Galaxy is a cloud computing. ELAND is a Solexa/Illumina developed alignment tool. FusionSeq is from Yale group. deFuse is from Canadian group. FusionHunter is
CCLE, Oncomine, GenePatten account Read More »
全文在這裡。把Copywriter改成paper writing, paper reading等等你每天要做的事情皆合適。Four points:1.Get More Sleep (7–8 hr/Day)2.Reduce Distractions (讓我想到在學校裡，一堂課40~50分鐘不讓你做雜事是有道理的)3.Eat the Frog (存疑)4.Set Mini-Deadlines (學習規劃最重要，避免眼高手低是可以訓練出來的)要提高工作效率，SFL認為睡飽飽很重要，DAVID則覺得吃飽飽也很重要，因此第3點建議很好，青蛙用來煮湯或三杯都很棒，這個作者不錯，知道青蛙可以用來補精力! 🙂 (素食者不宜) ps: “eat thr frog” 是指將比較困難或複雜的工作排在一天的開始，優先執行，如果完成了，不僅成就感大，其他較簡單的工作任務，就更容易完成了，因為最困難的不是完成了嗎? ~~共勉之 (謝謝DAVID桑的翻譯與重點提示!)
0610 生命科學院結構生物學程正取共： 5 名 （依准考證號排列）一般生 共 5 人06100001 李翊榮 06100002 林台文 06100003 周松濤 06100004 蔡彥俊06100006 林怡亭 08B 生科院醫學生物科技學程正取共： 6 名 （依准考證排列）一般生 共 6 人06080002 翁紹娙 06080004 陳瑜帆 06080005 鄒岳良 06080009 周松濤06080011 王義翔 06080013 劉秉鑫
厲害就是厲害-松濤又考上博士班了!! 怎麼辦呢! Read More »
Progress report:1. 欲確定在293TetLuc細胞中, Dox treatment 3-9hrs之間, CTCF結合在c-Myc/H19 promoter的pattern. 初步CTCF-ChIP assay結果顯示在兩個promoter上, CTCF的結合量未有明顯的改變. 之後將進行293TetER細胞的CTCF-ChIP assay. 2. 分析目前已知Rta會結合的promoters, 利用軟體預測Rta responsive element(RRE)/CTCF binding site(CBS)/sp1 binding site. 目前觀察到的情形如下:a) CTCF 與Rta結合位置重疊: BALF2, SFNb) CTCF 與Sp1結合位置重疊: p21, SFNc) CTCF/Rta/Sp1結合位置是鄰居: BLLF3, BHRF1/BHLF1分析結果未整理完全, 待續 3. 利用direct infection的方式建立攜帶螢光的293LucEV/293EREV. 所篩到的clone能被Dox induction出來的viral particles比EREV8少了至少10倍. 之後提高G418濃度也未能讓viral particles被release更多, 因此先停住這個實驗.
05/09 Lab Meeting-小嬿 Read More »
1.製備以下表現質體以供濁水溪公司代製兔子多株抗體 (1) pGEXHis_cZ :已分裝保存於-80℃冰箱。可用於WB(1:2000)(萍)、IFA(1:2000)(鏸)及免疫組織染色 (1:1000)(鏸)。(2) pGEXHis_ER_Q320stop and pGEXHis_ER_L550stop : Q320stop已送給濁水溪代製。另外構築pGEXHis_ER_277E-516V做蛋白質表達。(3) pGEXHis_KR_E600stop and pGEXHis_KR_Q658stop :蛋白質表現量太少(失敗)。(4) pGEXHis_BALF3 :蛋白質表現量太少(失敗)。 2.使用EGFP當目標基因來測試建立NP460TetR_ER inducible cell lines的條件：用未稀釋的lentivirus病毒液直接感染6小時後移除，細胞發綠光比例接近100%，之後細胞放大後，使用10 ug/ml zeocin作篩選16天，發現未加Dox與有加Dox的綠光比例類似，建議做WB(flag)作確認。 3.萍使用Mini-PROTEAN II multiscreen apparatus (Bio-rad)來進行抗體最佳稀釋倍數的實驗。相關資料在https://www.bio-rad.com/prd/en/US/LSR/PDP/f9ec3085-b590-44c6-9b36-b36876cad466/Mini-PROTEAN_II_Multiscreen_Apparatus 首先置備只有一個well的膠體，樣品量為單一well*20=200ug (萍通常使用量)，轉漬完的NC膜置於裝置內，略將裝置傾斜後，從下面的孔注入600ul抗體稀釋液(避免氣泡)，室溫靜置2小時後，以Tip移除抗體稀釋液，用TBST清洗3次後，將裝置打開把NC膜拿出，進行後續二抗的雜交實驗。
5/2 Lab Meeting-ingrid Read More »
IB Roninson pdf 1605, 1624 in Bound Book (Senescence 3/3) PDF 1624: Short-term expression of p21 led to rapid downregulation of genes involved in mitosis and DNA replication. However, a longer-term consequence of p21 induction resulted in the induction of multigenes (PDF 1605), many of which are involved in aging as well as secreting anti-apoptotic
Rta/p21/Senescence/Tumorigenesis Read More »
Have Fun (一份七頁的pdf) ~ (Click Me)
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1. 將DDR1 IP後的interacting proteins (no. 1-4) 切下後訂mass, 而no. 1約60 kDa, no. 2約75kDa, no. 3約85 kDa, no. 4約160 kDa的蛋白質, 其中最有興趣在一些OSCC細胞中可能有高度磷酸化的區域為no.2 利用MASCOT分析的結果統 整出較有可能的protein分別為 Heat shock 70 kDa protein 8, Heat shock 70 kDa protein 9 及 Polyadenylate-binding protein 1, 這些結果進一步需實驗進行驗證2. 利用OEC-M1處理Glivec後, 觀察抑制DDR1活性對OEC-M1的影響 結果發現細胞生長停止, 但細胞死亡的情形不明顯3. 觀察K2及K6細胞對Glivec的敏感性, 結果發現Glivec對於DDR1表達量較少的K2的生長抑制效果較差, 此結果仍須重複確認
0409 Lab meeting-蔡小丸 Read More »
—–Forwarded message—–附件是我下週要報的paper，(按我下載) 謝謝！ Y.-M.
04/18 Journal Club Paper Read More »