May 2012

厲害就是厲害-松濤又考上博士班了!! 怎麼辦呢!

0610 生命科學院結構生物學程正取共: 5 名 (依准考證號排列)一般生 共 5 人06100001 李翊榮 06100002 林台文 06100003 周松濤 06100004 蔡彥俊06100006 林怡亭 08B 生科院醫學生物科技學程正取共: 6 名 (依准考證排列)一般生 共 6 人06080002 翁紹娙 06080004 陳瑜帆 06080005 鄒岳良 06080009 周松濤06080011 王義翔 06080013 劉秉鑫

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05/09 Lab Meeting-小嬿

Progress report:1. 欲確定在293TetLuc細胞中, Dox treatment 3-9hrs之間, CTCF結合在c-Myc/H19 promoter的pattern. 初步CTCF-ChIP assay結果顯示在兩個promoter上, CTCF的結合量未有明顯的改變. 之後將進行293TetER細胞的CTCF-ChIP assay. 2. 分析目前已知Rta會結合的promoters, 利用軟體預測Rta responsive element(RRE)/CTCF binding site(CBS)/sp1 binding site. 目前觀察到的情形如下:a) CTCF 與Rta結合位置重疊: BALF2, SFNb) CTCF 與Sp1結合位置重疊: p21, SFNc) CTCF/Rta/Sp1結合位置是鄰居: BLLF3, BHRF1/BHLF1分析結果未整理完全, 待續 3. 利用direct infection的方式建立攜帶螢光的293LucEV/293EREV. 所篩到的clone能被Dox induction出來的viral particles比EREV8少了至少10倍. 之後提高G418濃度也未能讓viral particles被release更多, 因此先停住這個實驗.  

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5/2 Lab Meeting-ingrid

1.製備以下表現質體以供濁水溪公司代製兔子多株抗體 (1) pGEXHis_cZ :已分裝保存於-80℃冰箱。可用於WB(1:2000)(萍)、IFA(1:2000)(鏸)及免疫組織染色 (1:1000)(鏸)。(2) pGEXHis_ER_Q320stop and pGEXHis_ER_L550stop : Q320stop已送給濁水溪代製。另外構築pGEXHis_ER_277E-516V做蛋白質表達。(3) pGEXHis_KR_E600stop and pGEXHis_KR_Q658stop :蛋白質表現量太少(失敗)。(4) pGEXHis_BALF3 :蛋白質表現量太少(失敗)。 2.使用EGFP當目標基因來測試建立NP460TetR_ER inducible cell lines的條件:用未稀釋的lentivirus病毒液直接感染6小時後移除,細胞發綠光比例接近100%,之後細胞放大後,使用10 ug/ml zeocin作篩選16天,發現未加Dox與有加Dox的綠光比例類似,建議做WB(flag)作確認。 3.萍使用Mini-PROTEAN II multiscreen apparatus (Bio-rad)來進行抗體最佳稀釋倍數的實驗。相關資料在https://www.bio-rad.com/prd/en/US/LSR/PDP/f9ec3085-b590-44c6-9b36-b36876cad466/Mini-PROTEAN_II_Multiscreen_Apparatus 首先置備只有一個well的膠體,樣品量為單一well*20=200ug (萍通常使用量),轉漬完的NC膜置於裝置內,略將裝置傾斜後,從下面的孔注入600ul抗體稀釋液(避免氣泡),室溫靜置2小時後,以Tip移除抗體稀釋液,用TBST清洗3次後,將裝置打開把NC膜拿出,進行後續二抗的雜交實驗。

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