November 24, 2011

進度報告: 1. 確定ChIP的前置步驟條件:Cell: 4 x 10^7 cells/ml lysis bufferSonication: 45″ ON, 45″ OFF for 10-12 cycles (depend on cell type)2. 在TW01-EREV_2716細胞中, 觀察到CTCF在Dox處理24小時後結合在cellular promoters上的量比6hrs與未處理Dox的細胞來得多. 顯示 Rta的出現可能讓CTCF對這些promoter的affinity更好. 但是在EREV8細胞中, 同樣的時間點沒辦法看到類似的情況. –> 補齊其他cellular promoter的PCR detection.–> 目前推測TW01EREV-2716走lytic cycle的速度比EREV8來得快, 可能24hr還看不到CTCF在EREV8細胞的變化. 試試在EREV8細胞中觀察48小時的CTCF ChIP.