量化西方墨漬法
以後實驗室quantitate protein band請依以下步驟進行: Plasmid 最好是一起抽的一批, 因實驗室LB/BHI已過使用期限,希望大家每次抽質體時盡量使用新鮮media及LB plate (1-cm厚度最佳),超過一個月以上的media及plate請自行定時清理(請不要當福壽螺到處蔓延留種,謝謝)。 若質體中有SV40-ori, 請以293T為host (DLR/expression etc),其餘它種質體則用293。 Transfection (24~48 h)每次請做p-100/1 ml-lysate的份量(6x p-35/1.2-ml), protein lysate量一次到位,不要老是重複在養細胞/TF效率好像有問題/plasmid不夠…(姑且稱之為小鼻子小眼睛的實驗) 檢測各質體間表現量:(i) 請以wild-type為標準 (所以wild-type可能要多transfect一份),293T為host的取5-ug及10-ug, 293為host的取25-ug及50-ug protein extracts run數片小膠,確定所使用的西方墨漬條件可分出一倍和兩倍間的差異。若是過強,那就請在砍primary/ secondary antibody濃度、incubation時間、ECL強度上三件事情上做調整。(ii)依前步驟所訂出的條件run一片小膠檢查各檢體間是否差異很大,如有二倍以上差異而各步驟又沒有太大疑慮,那表示可能有protein stability/proteosome involved,值得設計其他實驗來分析之.兩倍以下差異者微調input量可繼續往下的實驗。(Plasmid, 細胞用畢的請定時清理,不要當福壽螺到處蔓延留種,謝謝)。 附註定量software有三款,請在Lab Protocol中找到小抄。