September 2008

9/30 Lab Meeting 心得彙整

Dual Luciferase assay: 所以,測試結果簡述如下. (1) Internal control: pFA-GAL4 系列因KRTA/TA在40ng/well/24-well plate含有約1K~2K的內生性renilla luciferase活性,所以最後選擇以活性最高的pEF1-RL為internal control. pLenti-Flag系列因pEF1-RL在不同activator:reporter比例被活化的程度不一, 所以選擇以variaion較少的pTK-RL或pTK-hRL為internal control. (3)(叮嚀:日後碰到)

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微RNA在蛋白層面上對基因表達的調控程度(MiRNA tunes proteins)

Widespread changes in protein synthesis induced by microRNAs / The impact ofmicroRNAs on protein output MicroRNAs可通過抑制一個信使RNA(mRNA)的轉錄或通過誘導其降解來調控基因表達。 雖然以前的研究工作已經在mRNA層面上對這種調控進行了測量,但過去對有多少調控發生在蛋白層面上仍不知道。現在,由David Bartel和Nikolaus Rajewsky領導的兩個小組,利用被稱為SILAC(全稱為“利用細胞培養中的氨基酸進行穩定同位素標記”)的方法的變通形式,對蛋白層面上所發生的蛋白組範圍內的變化作為內生和外生microRNAs的表達的一個函數進行了測量。他們發現,雖然microRNAs能直接抑制數百個基因的轉錄,但更多的間接效應卻能導致數千個基因的表達發生變化。然而,所觀察到的很多變化在數量級上不到兩倍,表明不管是直接還是間接,microRNAs都能充當“可變電阻器”,來微調蛋白合成,以便在任何一個給定的時間都能與細胞的需求相匹配。(Articles Nature 2008 SePost Optionsp-4-Vol 455:pp. 58, 64; Author page)

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Rta和MN

First of all, I want to clarify several disputing issues:1. Is Rta functional in the cytoplasm? Maybe, but most of the time Rta is working hard in the nucleus.表現量過多,過快,或是一邊進核一邊在胞質內”到此一遊留點紀念”的功能不是今天討論範圍.同理RtaNLSm在我心目中是一個細胞質蛋白,它的主要活性與核內的Rta應是截然不同的. 2. Does over-expression of Rta lead to MN formation in EBV-ve cells?是的,在楚穎論文裡,所算的p值都是許多次實驗重複驗證而成.據聞旻潔加做的synchronize細胞也可觀察到許多multinucleated, binucleated, and mis-segregated cells. 3. Does Rta-mediated MN formation contribute to NPC tumorigenesis?傾向不是.因為在有病毒genome存在下,Rta和其所活化的病毒蛋白會造成細胞停止生長或是凋亡.也就是說 cell

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原來是這樣..

var link=post.link[0].href;要多加判斷行三行(case sensitive所以P不是p; 最後一筆是j,不再是0),所以改成 -var j = 0; -while (j < post.link.length && post.link[j].rel != "alternate") -j++; -var link=post.link[j].href;感恩trifire和Abin君吶!美妙的JSON,Cool~

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大概會用吧 再囉唆一下

看到新的回應時,按一下該筆留言最下面的時間和作者(e.g. 2008-09-25-SFL),便可連結到原先發文的原文及所有回應之網頁. 讀完後按一下”首頁“(在最下方中間處)即可回家.另外在網頁最左上方有一個可以search本網誌的搜尋處,善用之可以快速找到你想要的舊資料.是word-search喔,所以只要是content中有的都行.試試”砂石車”, “Rta”,看看可以找出什麼. 好厲害的Google蠕形動物啊!

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金車回收機制

有人要辦理金車三合一咖啡/奶茶退貨者.這裡有專線電話.讓我們向這群有社會道德良心的業者拍拍手!另外,國內生產的牛奶是Okay的,還有三聚氰胺讓蛋白質濃度測出偏高的原理在這裡.

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一日遊報告&大家要去吃安平名產

我和另外四位老師7:45搭九人座小巴出發,吃了一個蘋果二片土司,8:15至竹北THSR,搭上自由席全滿只好加85元升等的441號8:45南下列車,9:49抵台南.出口處又碰到三位老師,一行八人搭上10:05爆滿且有許多人站著還上快速道路,最後把坐我旁邊小弟弟弄得暈頭轉向吐了出來又被阿公責備(弟弟)的接駁公車.10:45抵達統一大樓.11:00開會,12:15吃午餐.13:10~14:20閒聊閒逛.14:30解散.是你,會甘願就這樣回去嗎?? of course not. 於是我和另外二位老師壓迫一位地陪搭小黃到安平附近買了全世界第二好吃的武廟碗粿,永泰興蜜餞,東東蝦餅,喝了一杯兩角銀冬瓜茶,聽運匠阿伯說了一個神奇卻也令人心疼的老師受詐騙集團欺負的故事.這樣一去一返16:10又坐回駛在長榮路上往南徐徐而行的接駁公車上.16:48抵台南THSR,一陣緊湊衝刺之後(全天最刺激處),16:53坐在仍有空位的11號自由席車廂(If you are still reading,給我拍拍手).嘉義站上來了一位威儀極好的僧人,內心一陣清涼…台中站上來的人稍多,開始有人要用站的.18:02扺達高挑雄偉的竹北站,又看到三位出家人,提醒我該念念佛號了,整日心猿意馬地好浪費精力啊.於是在站內候車處出閉目養神一下,18:28等齊了沒趕上同一班車的另一位老師(我沒有被怨,因為..他人很好..嘿嘿),19:00返抵院區. 結論有三:1)CL的阿桑級招待就是不一樣,我覺得竹南比較像CA的家耶2)全台灣南北通車的人真的很多,THSR若有股票上市,可以考慮投資3)台南重要路段紅燈太多,而且應該synchronize一下提議有一:品嚐完給點意見. 我們把SOP寫出來,下次就可請南部同仁先買好,或宅配時達最佳效果.

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